随便一个名字1
晕了,大佬们能不能请教一下,敲低和过表达细胞应该怎么选啊,一会小干扰RNA、一会慢病毒转染、一会又是要找公司构建,应该怎么选择呢,比如plin3敲低过表达为什么是找公司构建呀
汤姆卜丽波
因为自己构建时间成本太高,还容易失败,现在发文章一般都需要敲低过表达双向验证,建议你提前做好准备
huarenqiang5
过表达载体:重点关注启动子、标签和选择标记。其中选择标记主要目的是区分表达与非表达目的基因的细胞。
敲低(减、降)表达载体:启动子选择 U6;标记选择通常跟过表达类似,尽量选择绿色荧光和 PURO。
敲除载体:目前最常用的就是 CRISPR-Cas9 的基因敲除载体,该系统是个二元结构,需要在同一个细胞中一起表达 Cas9 和针对目的基因的 sgRNA,优先推荐二合一型载体。
loveliufudan
选择敲低或过表达目标基因的方法可以从以下几个方面考虑:
1. 效率和稳定性:慢病毒系统效率高,可得到稳定敲低或过表达细胞株;siRNA敲低 temporary。
2. 负责制:病毒系统可能对宿主细胞有影响,需评估安全性。siRNA影响较小。
3. 细胞类型:对难转染细胞,病毒系统转导效率较好。siRNA可用于多种细胞。
4. 作用方式:siRNA主要下调mRNA水平,对编码蛋白水平影响有延迟;病毒系统可直接作用于蛋白表达调控。
5. 目标基因特点:对一些结构域复杂的蛋白,siRNA效果可能不佳,可考虑病毒系统。
6. 试验目的:探究机制性研究,可短期使用siRNA;需要稳定细胞株改造,则病毒系统更优。
7. 经费:病毒系统构建一般需外包,成本较高;siRNA价格相对低廉。
PLIN3作为蛋白结构较复杂的脂落相关蛋白,使用病毒系统可能效果更好。
综合考虑目标基因、细胞类型、实验目的和经费等因素,从中选择最适合的方法。
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