MS到底能不能实现ip后pg级别的蛋白组学分析？
丁香实验
老板想得到某种蛋白A结合的其他蛋白的数据，本来是用MS最直接，但是我们组织量起始也才10万-12万，更不用说还要ip A来做MS，我目前没有查到文献有IP-MS这么低量的。
但是老板提了个问题说，现在单细胞质谱那么低量都可以实现，为什么ip后不可以？由于文献没找到，我也实在是不太了解现在有没有哪种灵敏度极高的MS能够实现。想求助一下MS到底能不能实现ip后pg级别的蛋白组学分析？
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1 个回答
丁香实验
有帮助
pg级别鉴定是问题不大。问题有几点。主要判定依据是你ip下来的内源性蛋白在整个样品中有没有可能超过鉴定的下限。理论上10万细胞不算少，实际也是对应蛋白质组学而言。
但是考虑到你ip的条件，目标蛋白的内源性丰度，非特异结合的蛋白的情况，不能下定论能不能鉴定到。建议尝试。
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