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RNA是以核蛋白复合体的形式存在,所以在提取动物RNA时要利用高浓度的蛋白质变性剂,迅速破坏细胞结构,使核蛋白与RNA分离,释放出RNA。再通过酚、氯仿等有机溶剂处理、离心,使RNA与其他细胞组分分离,得到纯化的总RNA。在提取的过程中要抑制内源和外源的RNase活性,保护RNA分子不被降解。因此提取必须在无RNase的环境中进行。可使用RNase抑制剂,如DEPC是RNase的强抑制剂,常用来抑制外源RNase活性。提取缓冲液中一般含SDS、酚、氯仿、胍盐等蛋白质变性剂,也能抑制RNase活性。并有助于除去非核酸成分。
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异硫氰酸胍法(PLT )
1. 取新鲜动物组织0.1 ~0.2g 置于组织匀浆器中,加入预冷的细胞裂解液1ml, 在冰浴中迅速匀浆15 ~30s ,以充分研碎组织。然后将细胞悬浮液吸入另一试管中。
2. 加入2mol 醋酸钠(pH4.0 )120 μl ,充分混匀。
3. 加入1.2ml 酚:氯仿:异戊醇,充分混匀摇振10s ,冰浴15min 。
4. 将混合物转移至1.5ml Ep 管中,4 ℃,离心10 000r/min,20min.
5. 移取上层水相至另一Ep 管中,加入等体积的异丙醇,静置?C20 ℃,30min 沉淀RNA.
6. 4℃ ,离心12 000r/min ,15min.
7. 弃上清液,加入70% 乙醇400 μl, 洗涤RNA 沉淀物;如果RNA 沉淀物被悬浮,则4 ℃离心10 000r/min ,10min 。
8. 弃上清液,自然干燥,但应避免沉淀完全干燥,否则RNA 难以溶解。
9. 加入100 μl 无RNase 水重悬RNA ,或加1ml 无水乙醇和1/10 体积3mol 醋酸钠(pH4.0 ),?C70 ℃保存。
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用专用的RNA提取试剂盒,如果用Trizol法的话在后面清洗过程中多洗1~2遍。
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可用Trizol法提取高纯度RNA
1、将组织在液氮中磨成粉末后,再以50-100mg组织加入1ml的Trizol液研磨;每2E6个细胞加入1mLTrizol.注意样品总体积不能超过所用Trizol体积的10%.
2、研磨液室温放置5min,然后以每1ml Trizol液加入0.2ml的比例加入氯仿,盖紧离心管,用手剧烈摇荡离心管15秒,静置5min,12,000rpm离心5min.
3、取上层水相于一新的离心管,按每1ml Trizol液加0.5ml异丙醇的比例加入异丙醇,剧烈振摇使混匀,4℃,12,000rpm离心10min.
4、弃去上清液,按每1ml Trizol液加入至少1ml的比例加入70%乙醇,涡旋混匀 ,4℃×7,500rpm×5min.
5、重复以上步骤.
6、小心弃去上清液,然后室温或真空干燥5-10min,加入30μL RNase Free的水中.
7、电泳检测.
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