上海欧易
(1)提前准备好试剂:三氯甲烷(氯仿),异丙醇,75℅乙醇(需要4°C预冷),无RNase的水、Trizol reagent。
(2)准备好枪头和EP管,注意需提前做好高温灭菌,或使用无RNase的枪头和EP管。
(3)离心机先进行4度预冷。
(4)实验需要在超净工作台中进行,实验开始前打开超净台紫外灯15min以上,并用酒精擦拭台面进行消毒;
(5)全程穿好白大褂,带好口罩和手套,一方面放置污染,一方面也是保护自己;注意回到超净台时,双手用酒精消毒。
(6)配置溶液,尤其是溶解RNA时,使用无RNase的水。
(7)匀浆时如果样品中含有较多蛋白、脂肪、多糖或肌肉、植物结节部分等,可离心去除。离心得到的沉淀中包括细胞外膜、多糖、高分子量DNA,上清中含有RNA。处理脂肪组织样品时,上层是大量油脂,应除去。取澄清的匀浆溶液进行下一步操作。
(8)加氯仿后,样品会被分成三层:红色的有机相,中间层和上层无色的水相,RNA主要在水相中,吸取水相时一定要注意不能吸到其他部分。
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操作台面酒精消毒,带好手套、口罩和白大褂,尽量在冰上操作
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1.从少量的组织(1—10 mg)或细胞(102—104)中分离RNA 样品:往组织或细胞中加入800 祃 TRIZOL。待样品裂解后,加入氯仿并进行步骤2中的抽提操作。在用异丙醇沉淀RNA之前,加入5—10μg无RNA酶的脂质体(Cat.No 10814)作为水样层的载体。为降低其黏度在加入氯仿前用26号注射器抽吸两次以切断基因组DNA。脂质体会留在水样层中并和RNA共析出。在浓缩到4 mg/ml之前它不会抑制第一丝状体的合成也不会抑制PCR。
2.在匀化后和加入氯仿之前,样品可以在–60—–70°C保存至少一个月。RNA沉淀(步骤4,RNA洗脱)溶于75%的乙醇在2—8°C至少可以保存一周,在–5到–20°C下至少可保存一年。
3.整个操作要带口罩及一次性手套,并尽可能在低温下操作,低温可以避免脆弱的RNA被降解。
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1. 从少量样品中提取RNA(1-10mg组织或102-104细胞) :加800ul Trizol,样品裂解后加氯仿,分层,沉淀RNA前,加5-10ug RNase-free糖原,糖原会与RNA一同沉淀出来,糖原浓度不高于4mg/ml时不会影响反转录cDNA第一链的合成,也不影响PCR反应。
2. 匀浆后,加氯仿前,样品可在-70 ℃放置一个月以上:RNA沉淀可以保存在75%酒精中,2-8 ℃一个星期或-20 ℃一年以上。如果要长期保存,RNA可以溶解于100%去离子甲酰胺中,-70 ℃长期保存。
预防RNase污染,应注意以下几个方面:
1. 经常更换新手套。因为皮肤经常带有细菌,可能导致RNase污染。
2. 使用无RNase的塑料制品和枪头,避免交叉污染。
3. RNA在Trizol试剂中不会被RNase降解。但提取后继续处理过程中应使用不含RNase的塑料和玻璃器皿。玻璃器皿可在150 ℃烘烤4h,塑料器皿可在0.5M NaOH中浸泡10min,然后用水彻底清洗,再灭菌,即可去除RNase。
4. 配制溶液应使用无RNase的水(将水加入到干净的玻璃瓶中,加入DEPC至中浓度0.1%(v/v),放置过夜,高压灭菌。注:DEPC有致癌之嫌,需小心操作)。
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