dxy_i93oax94
各位老师,我用Trizol法提取RNA后,跑普通琼脂糖电泳检测完整性后续用于测序,电泳图如下。
样本为细菌RNA,样本浓度:550 ng/μL,A260/280:1.98,A260/A230:1.70。
样本电泳:上样量1500ng,电压140V,15 min,因条件限制,电泳设备和电泳液均没有保持无RNA酶,无RNA marker,但电泳液,胶均是新配的,RNA提取完立即上样。
请问为什么会出现四根条带?从上到下分别是23s,16s,5s?那最后一根是什么,是降解产物吗?还是第四根是5s?
huarenqiang5
从图片及操作综合分析考虑最后一根是降解产物。
dxy_i93oax94
好的,谢谢
sswei
几种可能:
1.可注意RNA的降解:RNA部分降解的可能性很大
2.注意污染:细胞裂解后离心,取样时需要小心,只能取上清夜,如果取到中间层则可能引起的污染。
dxy_i93oax94
好的,谢谢
loveliufudan
从您提供的信息来看,最可能的情况是这四个条带分别代表细菌的16S rRNA,23S rRNA,5S rRNA和降解产物。这是因为在细菌中,16S和23S rRNA通常是以一个大的前体RNA形式存在,所以通常会出现两个强条带;而5S rRNA通常是单独存在的,因此会出现一个相对较弱的条带。至于最后一个条带,可能是由于RNA的降解产物引起的。
需要注意的是,电泳图上的条带强度和位置可能会受到多种因素的影响,包括RNA提取和电泳条件等。因此,您可以尝试进行更多的实验,以确定这四个条带的确切大小和身份,并评估RNA样品的完整性和质量。
dxy_i93oax94
好的,谢谢
土井挞克树
这个看着像是稳定的降解产物的条带。
dxy_i93oax94
第四根吗?谢谢!
相关产品推荐
相关问答