直接提取并检测dna的话 引物设计有哪些注意的点?和那种mRNA逆转录成cDNA再进行检测所使用的引物以及设计过程是一样的吗?

直接提取的话引物需要处理，比如把不翻译的修饰部分去掉。

直接提取井检测DNA的引物设计需要考虑以下几个注意点：

特异性：引物应该与目标DNA序列特异结合，而不与非目标DNA序列结合，以避免假阳性或假阴性的情况出现。

互补性：引物应该相互补合，即引物的5'端与目标DNA序列的3'端互补，引物的3'端与目标DNA序列的5'端互补。

GC含量：引物的GC含量应该控制在40%-60%之间，以确保引物与目标DNA序列的互补性。

碱基长度：引物的长度应该在18-25bp之间，以确保引物与目标DNA序列的特异性。

对于将mRNA逆转录成cDNA后进行检测所使用的引物以及设计过程，与直接提取井检测DNA的引物设计有些不同，需要注意以下几点：

避免污染：反转录过程中需要避免RNA污染和DNA污染。

选择合适的引物：由于cDNA比DNA相对较短，因此引物的长度应该更短，通常为15-22bp。

选择合适的引物位置：引物应该选择在靠近3'端的位置，以确保可以检测到完整的mRNA序列。

逆转录反应：反转录反应需要选择合适的反转录酶和反应条件，以确保反转录反应的效率和准确性。

因此，直接提取井检测DNA的引物设计和将mRNA逆转录成cDNA后进行检测所使用的引物以及设计过程并不完全相同，需要根据不同的应用场景进行合理选择。

引物不一样的哈，因为DNA模板是DNA，有内含子和外显子，而mRNA逆转录的是cDNA，只有外显子

基因组DNA包含内含子 所以要在基因组序列而非mRNA序列上设计引物，否则有可能因不能跨越内含子而扩增失败 引物设计的原则（特异性、GC含量、碱基结构）都是一样的 。