一个质粒的双酶切，两种酶buffer一样，同时切胶。跑胶时，一个小片段看不到，大概600bp，怎么办？根据Marker把需要的4

第一步先确定你的酶切的酶没有所问题，所以要做两个单酶切的对照，然后看单酶切和双酶的长切片段的大小，如果有差异，说明酶没有问题。否则重新买酶。第二步，一定要胶回收，需要去除乙醇沉淀带进去的杂质，否则会影响下一步的连接

可能就是两种酶的酶切效率相差甚远，一种酶活性非常好，一种酶则活性很弱，这样就会产生看不到酶切片段的情况。而造成这种情况，一般都是通用buffer没有选好，所以你要看两种内切酶的说明书，选择一种两种酶都具有很好活性的buffer进行酶切。实在没有很好的通用buffer，那么你需要延长酶切时间。

两个酶的BUFFER和温度都不一样，在做双酶切时是不是该考虑一下几方面？ 1.双酶切时如果两种酶反应温度一致而buffer不同时，可查阅内切酶供应商在目录后的附录中提供的各种酶在不同buffer中的活力表，如果有一种buffer能同时使2种酶的活力都超过70%的话，就可以用这种buffer作为反应buffer。如果两种酶厂家不同无法查时可比较其buffer成份，相似的话可以考虑各取一半中和。2. 如果2种酶的buffer成份相差较大或2种酶的反应温度不同则必须分别做酶切。第1种酶切后要考虑用酚抽、电泳或加热等方法使酶失活后再进行下一次酶切反应。厂家目录一般都会有相应的附录以供查阅各种酶的反应温度。有的酶可以用加热使之失活，有的则不行，这些信息也可以在有关附录中查询。3.第一次酶切后通过电泳确证酶切完全后可以从胶中回收DNA片段再进行下次酶切，也可以在第一个酶切后直接用PCR产物回收试剂盒或Nucleotide Removal Kit纯化酶切样（只需5分钟），保留少量样品做电泳分析之用，再进行下一次酶切。还可以用一种离心纯化管或叫做离心浓缩管(Eppendorf,S&S等厂家有售)，将酶切样加入后离心，盐等成份被过滤掉而核酸则被截留在柱子中间的膜上，加入适量ddH2O,离心以洗去膜上残留的杂质，再加几微升ddH2O在膜上，将柱子反转插入新的eppendorf管上，离心，即可将DNA片段离下来，做下一次酶切。特别注意：在双酶切载体时如果2个酶切位点距离很近，必须注意酶切顺序。因为有的限制性内切酶要求其识别序列的两端至少保留有若干个碱基才能保证酶的有效切割。有的酶要求识别序列两端有多个碱基的，则必须先切，否则就可能造成酶切失败。比如质粒pLITMUS29的多克隆位点中BamH I旁边有HindIII位点，如果先切BamH I再切HindIII 时就会出现HindIII切不动的情况，但是反过来就没问题。更详细的数据可参考相应的附录。

你可以试试图片中提及的方法来拯救：