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分享:PCR 引物设计及软件使用技巧

PCR 引物设计及软件使用技巧张新宇,朱有康,高燕宁(中国协和医科大学中国医学科学院肿瘤研究所,北京100021)摘要:本文旨在介绍使用软件设计PCR 引物的技巧。在PCR 引物设计原则的基础上,详细介绍了两种常用引物设计软件的基本使用方法,并对其各自的优缺点进行了比较。一般性引物自动搜索可采用“Premier Primer 5”软件,而引物的评价分析则可采用“Oligo 6”软件。关键词:PCR;引物设计中图分类号:Q524 文献标识码: 文章编 ...

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【交流】Gateway的原理

Gateway也可以被视为一种克隆操作平台:把目的基因克隆到入门载体(Entry Vector)后,就不用依赖限制性内切酶,而靠载体上存在的特定重组位点和重组酶,高效、快速地将目的基因克隆到其它的受体载体(Destination Vector,目的载体)上。Gateway的原理也是建立在噬菌体DNA定点整合到细菌宿主基因组上。在噬菌体和细菌的整合因子(INF、Int)的作用下,lambda的attP位点和大肠杆菌基因组的 ...

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【共享】DNA测序常见英文对照(转载)

转载,感谢原作者DNA测序常见英文单词对照(1)Quantitative analysis of expression of myocardial CYP11B1 and CYP11B2 genes in rats of two groups Taking 100bp Plus Ladder as Marker,clear amplified strands could be seen at 440bp?461bp and 336bp sites,DNA sequencing proved they were the encoding gene seg ...

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【交流】RNAi的原理与视频演示

RNAi原理及演示1 RNAi的机制RNAi的机制可能是细胞内双链RNA在Dicer酶的作用下,可形成-22 bp大小的小干扰RNA(small interfering RNAs,siRNAs),siRNAs可进一步掺入多部分核酸酶(multicomponent nuclease,RISC)并使其激活,从而精确降解与siRNAs序列相同的mRNA,完全抑制了该基因在细胞内的翻译和表达.RNA酶Ⅲ是一种能切割双链RNA的酶,参与RN ...

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【共享】测序峰图的高通量分析软件介绍二 Sequencher

Sequencher - DNA 序列分析软件Sequencher 是 DNA 序列分析的工业标准软件。它可以和所有的自动序列分析仪一同工作,并且因为它的极速 Contig 组装、很短的学习曲线、用户友好的编辑工具,以及卓越的技术支持而众所周知。从差不多 15 年前释出第一个版本到现在,Sequencher 在每个基因专业和制药公司中都应用与于序列分析任务,同时在全球超过40个国家里为数众多的学术和政府实验室中使用。Sequencher 被生命科学研究 ...

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【交流】基因克隆知识问答及FAQ

基因克隆是指在体外将含有目的基因或其它有意义的Dundefined*段同能够自我复制的载体DNA连接,然后将其转入宿主细胞或受体生物进行表达或进一步研究的分子操作的过程,因此基因克隆又称DNA克隆、分子克隆、基因重组或重组DNA技术。基因克隆涉及一系列的分子生物学技术,如目的Dundefined*段的获得、载体的选择、各种工具酶的选用、体外重组、导入宿主细胞技术和重组子筛选技术等等。为了方便大家学习和交流,我以问答形式介绍基因克隆及其常见 ...

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【转帖】影响电泳分离的主要因素:

影响电泳分离的主要因素:1. 待分离生物大分子的性质:待分离生物大分子所带的电荷、分子大小和性质都会对电泳有明显影响。一般来说,子带的电荷量越大、直径越小、形状越接近球形,则其电泳迁移速度越快。2. 缓冲液的性质:缓冲液的pH值会影响待分离生物大分子的解离程度,从而对其带电性质产生影响,溶液pH值距离其等电点愈远,其所带净电荷量就越大,电泳的速度也就越大,尤其对于蛋白质等两性分子,缓冲液pH还会影响到其电泳方向,当缓冲液p ...

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【共享】超经典的《miRNA实验指南》,美 Shao-Yao Ying主编 军事医学科学院 郑晓飞 主译

超经典的《miRNA实验指南》,美 Shao-Yao Ying主编军事医学科学院郑晓飞主译。研究microRNA的同仁值得一看。目录第一章microRNA---调控基因功能的RNA基因概述第二章microRNA前体结构分析第三章microRNA的生物形成-----分离与鉴定微处理体复合物第四章Pri-miRNA转录物的识别与切割第五章 以小鼠胚胎干细胞为遗传系统模型探索RNA干扰机制第六章microRNA与信使RNA的回归 ...

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【交流】干细胞重大进展!!

http://blog.bioon.com/user3/26347/archives/2007/148549.shtml含全文下载日本和美国科学家进行的两项独立研究,首次利用人体测表皮细胞制造出了类胚胎干细胞。这一技术有望用于特定疾病的干细胞研究和治疗,并且避开了利用晶胚或卵母细胞获得胚胎干细胞的伦理争议。相关论文分别在线发表于《细胞》和《科学》杂志。近些年来,从事干细胞研究的科学家已经试图将一些正常的体细胞直接转化 ...

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【共享】某机构发表的核酸相关研究的文章(EST,SNP等),PDF全文下载

刚才查文献时看到的,某机构发表的核酸相关研究的文章,都已经提供了PDF格式的链接。大家看看有没有自己需要的文献。http://genome.imb-jena.de/publications/index.pl2006:Birkenmeier G, Nicklisch S, Pockelt C, Mossie A, Steger V, Glaser C, Hauschildt S, Usbeck E, Huse K, Sack U, Bauer M, Schafer A (2006)Polymyxin B-conjugated ...

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【下载】图书:Human Genetics: Concepts and Applications

Human Genetics: Concepts and Applications(5th edition)Amazon网站介绍: http://www.amazon.com/Human-Genetics-Applications-Ricki-Lewis/dp/007246268XAuthor: Ricki LewisISBN: 007246268XPublisher: McGraw-Hill, 2002Format: PDF - 440 pagesSize: 79.5 MBook Desc ...

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帮帮我这个初学者吧

我在ExonPrimer(http://ihg.gsf.de/ihg/ExonPrimer.html)网页上设计引物,结果如下,不知道行不行?我是新手,我不明白这些参数,也看不懂,请各位多多指教。我要做的外显子是666bp的。Exon1: 666 bpOLIGO start len tm gc% any 3' rep seqLEFT PRIMER 225 20 58.19 50.00 2.00 2.00 12.00 GGTCTGTGTTTTGTTCCTGCRIGHT PRIMER 950 27 55.92 37.04 4. ...

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【资源】ambion已公布有效的siran序列

http://www.ambion.com/techlib/tb/tb_502.htmlPublished siRNA Target SequencesApril 2003 - The significant increase in the rate of publication of siRNA target sequences has made it difficult to maintain a comprehensive list of these sequences. Therefore, we will no longer be upda ...

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【资源共享】向国外机构索要生物材料的英文信(样本)

Dear ×××(某外国机构名称),Thanks you for your kind assistance to our research project.I am an associate professor in ×××××××××(国内研究所或大学机构名称,最好不要用公司,以免被怀疑商业目的) and also member of the State Key Laboratory. And one of my projects focuses on ××××××(简单一句介绍实验目的). Isolating cells seems to be a problem hard to g ...

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【原创】发现一个一篇文章的一个错误。

文献的作者:Suzuki J, Fukuda M, Kawata S, Maruoka M, Kubo Y, Takeya T, Shishido T.题目:A rapid protein expression and purification system using Chinese hamster ovary cells expressing retrovirus receptor.期刊:J Biotechnol. 2006 Dec 1;126(4):463-74.PMID: 167660742.1. Cloning of EcoRAn ecotropic ...

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【bio-news】千人基因组计划:准备测序

1000 Genomes Project: ready to sequence07/05/2010Erin PodolakData from the three pilot projects recently conducted to determine how to sequence human genomes for the 1000 Genomes Project is now available, moving the project into its next phaseThe 1000 Genomes Project, an internatio ...

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最新基因组学术语表New Genome Glossary

最新基因组学术语表New Genome GlossaryGenome GlossaryAAdenine (A): A nitrogenous base, one member of the base pair AT(adeninethymine).Allele: Alternative form of a genetic locus; a single allele for each locus isinherited separately from each parent (e.g., at a locus for eye color the allelemig ...

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碱裂法提取BAC

Preparation of BAC (Bacterial Artificial Chromosome) DNA with by Alkaline Prep Method1. Grow 250 ml of LB culture at 37 °C for 16 hours ( 250 rpm) with the appropriate antibiotic. Cultures can be started by 1) picking a single colony or 2) by splitting a subculture into 250 ml of culture (1 L Flasks). Colonies shou ...

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【资源】麻省理工学院(MIT)生物学课件(包括本科、研究生和博士后)

可以肯定很多战友知道麻省理工学院的课件已经在网上全部公布,但有些战友可能不知道在哪里可以看到他们。下面提供支持在线浏览的生物学课件的网址给大家(并且这些教程是可以下载的)http://www.core.org.cn/OCW_CN/Biology/index.htm我想这对很多战友来说是不可多得的好教材。坦白来说,我把它当成一种财富,我近期已经阅读了他的遗传学教程,发现真的讲得很好,深入浅出的为我们讲述了遗传学的方方面 ...

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【共享】Highly Efficient Ligation for Large Inserts

我从网上看到的,与大家分享。点此下载Highly Efficient Ligation for Large InsertsOne of the major problems with the success of ligation reactions, and thus the cloning experiment as a whole, is ensuring the restriction digests are complete and the dephosphorylation of the vector termini was successf ...

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