帮帮我这个初学者吧
丁香园论坛
638
我在ExonPrimer（http://ihg.gsf.de/ihg/ExonPrimer.html）网页上设计引物，结果如下，不知道行不行？我是新手，我不明白这些参数，也看不懂，请各位多多指教。我要做的外显子是666bp的。
Exon1: 666 bp
OLIGO start len tm gc% any 3' rep seq
LEFT PRIMER 225 20 58.19 50.00 2.00 2.00 12.00 GGTCTGTGTTTTGTTCCTGC
RIGHT PRIMER 950 27 55.92 37.04 4.00 0.00 12.00 TCTAGGTGTATGACTATTTCTCTTCTC
PRODUCT SIZE: 726, PAIR ANY COMPL: 3.00, PAIR 3' COMPL: 0.00
TARGETS (start, len~undefined: 245,670
180 TAGTCCTTTAGTTGATACTTGTTGAATAATGTTAATAATACTCAAGGTCTGTGTTTTGTT
>>>>>>>>>>>>>>>
240 CCTGCAGGTTGATCCAAAAGACTACATGTTCAGTGGACTGAAGGATGAAACAGTAGGTCG
>>>>>Xundefined***************************************************~Kbr_~H~M~2~1~Kbr_~H~M~2~1300_CTTACCTGGGACGGTAGCAGGACAACAGTTTCTCATTCAAGACTGTGAGAACTGTAACAT~Kbr_~H~M~2~undefined**********************************************************~Kbr_~H~M~2~1~Kbr_~H~M~2~1360_CTATATTTTTGATCACTCTGCTACAGTTACCATTGATGACTGTACTAACTGCATAATTTT~Kbr_~H~M~2~undefined**********************************************************~Kbr_~H~M~2~1~Kbr_~H~M~2~1420_TCTGGGACCCGTGAAAGGCAGCGTGTTTTTCCGGAATTGCAGAGATTGCAAGTGCACATT~Kbr_~H~M~2~undefined**********************************************************~Kbr_~H~M~2~1~Kbr_~H~M~2~1480_AGCCTGCCAACAATTTCGTGTGCGAGATTGTAGAAAGCTGGAAGTCTTTTTGTGTTGTGC~Kbr_~H~M~2~undefined**********************************************************~Kbr_~H~M~2~1~Kbr_~H~M~2~1540_CACTCAACCCATCATTGAGTCTTCCTCAAATATCAAATTTGGATGTTTTCAATGGTACTA~Kbr_~H~M~2~undefined**********************************************************~Kbr_~H~M~2~1~Kbr_~H~M~2~1600_TCCTGAATTAGCTTTCCAGTTCAAAGATGCAGGGCTAAGTATCTTCAACAATACATGGAG~Kbr_~H~M~2~undefined**********************************************************~Kbr_~H~M~2~1~Kbr_~H~M~2~1660_TAACATTCATGACTTTACACCTGTGTCAGGAGAACTCAACTGGAGCCTTCTTCCAGAAGA~Kbr_~H~M~2~undefined**********************************************************~Kbr_~H~M~2~1~Kbr_~H~M~2~1720_TGCTGTGGTTCAGGACTATGTTCCTATACCTACTACCGAAGAGCTCAAAGCTGTTCGTGT~Kbr_~H~M~2~undefined**********************************************************~Kbr_~H~M~2~1~Kbr_~H~M~2~1780_TTCCACAGAAGCCAATAGAAGCATTGTTCCAATATCCCGGGGTCAGAGACAGAAGAGCAG~Kbr_~H~M~2~undefined**********************************************************~Kbr_~H~M~2~1~Kbr_~H~M~2~1840_CGATGAATCATGCTTAGTGGTATTATTTGCTGGTGATTACACTATTGCAAATGCCAGAAA~Kbr_~H~M~2~undefined**********************************************************~Kbr_~H~M~2~1~Kbr_~H~M~2~1900_ACTAATTGATGAGGTAAGGAGAAAGAGAAGAGAAATAGTCATACACCTAGATTTAAAAAT~Kbr_~H~M~2~undefined***********XX_~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~Kbr_~H~M~2~1~Kbr_~H~M~2~1960_GTACCACTCTGGAGTACTTCCATTCTTTTCAAATTGGCTATTGGAAATACAGGCAACCCT~Kbr_~H~M~2~1...................................
Exon1: 666 bp
OLIGO start len tm gc% any 3' rep seq
LEFT PRIMER 225 20 58.19 50.00 2.00 2.00 12.00 GGTCTGTGTTTTGTTCCTGC
RIGHT PRIMER 950 27 55.92 37.04 4.00 0.00 12.00 TCTAGGTGTATGACTATTTCTCTTCTC
PRODUCT SIZE: 726, PAIR ANY COMPL: 3.00, PAIR 3' COMPL: 0.00
TARGETS (start, len~undefined: 245,670
180 TAGTCCTTTAGTTGATACTTGTTGAATAATGTTAATAATACTCAAGGTCTGTGTTTTGTT
>>>>>>>>>>>>>>>
240 CCTGCAGGTTGATCCAAAAGACTACATGTTCAGTGGACTGAAGGATGAAACAGTAGGTCG
>>>>>Xundefined***************************************************~Kbr_~H~M~2~1~Kbr_~H~M~2~1300_CTTACCTGGGACGGTAGCAGGACAACAGTTTCTCATTCAAGACTGTGAGAACTGTAACAT~Kbr_~H~M~2~undefined**********************************************************~Kbr_~H~M~2~1~Kbr_~H~M~2~1360_CTATATTTTTGATCACTCTGCTACAGTTACCATTGATGACTGTACTAACTGCATAATTTT~Kbr_~H~M~2~undefined**********************************************************~Kbr_~H~M~2~1~Kbr_~H~M~2~1420_TCTGGGACCCGTGAAAGGCAGCGTGTTTTTCCGGAATTGCAGAGATTGCAAGTGCACATT~Kbr_~H~M~2~undefined**********************************************************~Kbr_~H~M~2~1~Kbr_~H~M~2~1480_AGCCTGCCAACAATTTCGTGTGCGAGATTGTAGAAAGCTGGAAGTCTTTTTGTGTTGTGC~Kbr_~H~M~2~undefined**********************************************************~Kbr_~H~M~2~1~Kbr_~H~M~2~1540_CACTCAACCCATCATTGAGTCTTCCTCAAATATCAAATTTGGATGTTTTCAATGGTACTA~Kbr_~H~M~2~undefined**********************************************************~Kbr_~H~M~2~1~Kbr_~H~M~2~1600_TCCTGAATTAGCTTTCCAGTTCAAAGATGCAGGGCTAAGTATCTTCAACAATACATGGAG~Kbr_~H~M~2~undefined**********************************************************~Kbr_~H~M~2~1~Kbr_~H~M~2~1660_TAACATTCATGACTTTACACCTGTGTCAGGAGAACTCAACTGGAGCCTTCTTCCAGAAGA~Kbr_~H~M~2~undefined**********************************************************~Kbr_~H~M~2~1~Kbr_~H~M~2~1720_TGCTGTGGTTCAGGACTATGTTCCTATACCTACTACCGAAGAGCTCAAAGCTGTTCGTGT~Kbr_~H~M~2~undefined**********************************************************~Kbr_~H~M~2~1~Kbr_~H~M~2~1780_TTCCACAGAAGCCAATAGAAGCATTGTTCCAATATCCCGGGGTCAGAGACAGAAGAGCAG~Kbr_~H~M~2~undefined**********************************************************~Kbr_~H~M~2~1~Kbr_~H~M~2~1840_CGATGAATCATGCTTAGTGGTATTATTTGCTGGTGATTACACTATTGCAAATGCCAGAAA~Kbr_~H~M~2~undefined**********************************************************~Kbr_~H~M~2~1~Kbr_~H~M~2~1900_ACTAATTGATGAGGTAAGGAGAAAGAGAAGAGAAATAGTCATACACCTAGATTTAAAAAT~Kbr_~H~M~2~undefined***********XX_~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~8lt~J~Kbr_~H~M~2~1~Kbr_~H~M~2~1960_GTACCACTCTGGAGTACTTCCATTCTTTTCAAATTGGCTATTGGAAATACAGGCAACCCT~Kbr_~H~M~2~1...................................
