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【求助】请教非单一且高度同源基因的RNAi问题,研究过小鼠骨钙素的请进

简繁 小鼠有三个串联的骨钙素(BGP,或OC)基因OG1、OG2、ORG,其中OG1和OG2在骨中表达,其基因序列高度同源但不完全一致,产物mRNA及蛋白亦稍有序列差别。但是看文献中的骨钙素mRNA 的RT-PCR检测,均不提引物根据哪个基因设计;蛋白水平的检测亦不区分BGP1和BGP2,市面的小鼠骨钙素放免或酶免试剂盒亦笼统一用。请教:我要做小鼠源成骨细胞的BGP RNAi,该以哪个基因为靶基因?随便选其中一个还是两个都照 ...

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【求助】请教各位老师,如何检测一个细菌中的已知序列后的一个功能基因

clarck7 请教各位老师,如果检测一个细菌中的已知序列后的一个功能基因说具体点,我用PCR扩得了一个IS的启动子,但想知道这个启动子的下游接的什么基因,请问如何实现?谢谢了!gingivalis 菌落杂交1 作 DNA cosmid 文库。2 PCR 扩增 IS 启动子,放射性同位素或者非放射性(地高新)标记做探针。3 plate hybridization. 找出阳性克隆,然后粘粒测序。或者1 PCR 扩增 IS 启动子,放射性同位素或者非放射性(地高新)标记做探针用。2 酶切细 ...

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【求助】rabbit beta-globin intron这个内含子有什么作用啊?

maiqitu 在构建载体的时候要往里面加rabbit beta-globin intron,请问是为什么呢?谢了啊zhujoker 那你到底是构建什么载体啊?还需要往里面加rabbit beta-globin intron,我也觉得奇怪。但是有一个东西是可能的,那就是你构建的是miRNA表达质粒,因为miRNA位于大多数基因间,也就是位于内含子得地方?不知道是不是你所想要的,呵呵!hcai55 恩,miroRNA表达载体有些是这样。比如 ...

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【求助】NMDA的PC12细胞损伤模型,请指教!

fankie 现在正在建立NMDA的PC12细胞损伤模型, 查了一些资料和文献, 但模型效果就是不好也添加了GLYCINE, 还是没甚么效果请问这里有做这方面的战友吗?是不是还需要添加GLU?? 或者需要NGF诱导分化2天后再加NMDA呢?谢谢大家帮忙~~~freecell 建议参考一下这篇文献,引用了21次。具体细节,可以写信给作者探讨。http://www.springerlink.com/content/h27367324p765h31 ...

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【求助】如何确认所得到的序列是转录因子?

haichao 从构建的表达文库中,通过DNA-protein互做调转录因子时,测序得到的片段如何进行分析确认是我想要的转录因子?因为我将得到的转录因子是未知的东西,所以对于拿回的测序结果很茫然不知如何去分析?请高手指点。小长 请问您是用酵母单杂交的方法拿到的蛋白吗?是否可以找到这个蛋白的基因序列?拿到蛋白测序结果后,当然是blast一下是否有同源蛋白?那些同源蛋白是否有转录因子?如果这样都没有结果,可以拿蛋白序列做 ...

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【讨论】一个关于基因芯片的疑问?

cherytmmu 大家知道基因芯片是在一定介质上的微阵列,一般一个2x2cm的介质能够点样6000个基因,点上的基因一般是通过PCR扩增而来的,有些点基因的功能甚至是不知道的,那我的疑问是这么多基因是怎么选择的,是通过cDNA文库扩增的吗,还是根据覆盖范围筛选出来的组合,这种基因芯片能够适用不同的物种吗?我想有这方面疑问的肯定有很多人,有做过这方面工作的站友能够给大家讲解这方面的知识吗,谢谢!ebio66 目前对 ...

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【求助】怎么才能获取beta catenin的基因?

liqiuling 怎么才能获取beta catenin的基因?chuckdouble pubmed里面有Nucleotide.到那里找.liqiuling 不太会看,而且合成的话,很贵,想知道如果想获得别人的惠赠,该怎样做?哪位大侠支个招?不胜感激!lmnsmu 在NCBI的核酸库中找到其序列,然后设计引物,通过RT-PCR扩增获得该基因,如果可以的话,胶回收其片段,从而得到。想惠赠的话,可以和文献的作者联系,最好是国外的,但是一般是 ...

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【求助】请教有哪些蛋白容易被氧化,或者容易被还原

oveiyi 先谢过了oveiyi 就是容易被氧化或者容易被还原的蛋白redox proteingingivalis 铁硫蛋白应该可以算。不知道血红蛋白能不能算?电子传递链中的蛋白质算不算?oveiyi 多谢楼上,这些都算哈,还有别的吗本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙伴师兄微信号:shixiongcoming

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【求助】关于鉴定基因isoform问题

otolaryngology 我现在有个问题求助各位大侠:我想检测一个不太成熟的基因在不同组织的isoform,可是不知道采用什么方法呀?生物信息学方法能为我们提供什么帮助呢?这个基因的其他物种的基因组序列尚未完全标注。还有就是请问各位大侠,EST数据库应该如何用呢?问题比较多,谢啦!otolaryngology 请各位大侠指点迷津,我的Email:hollyzyl@126.comzhujoker 请问楼上的你所谓的“一个 ...

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【求助】请问哪里能查到microRNA各家族具体组成

dreamlj200 RT,因为初涉该领域,总是搞不清,有时编号不同的microRNA又来自一个家族,哪位大侠能够给提供一个地址查阅,谢谢zhujoker microRNA各家族具体组成还没有相应的数据库,但是microRNA家族目前的定义是种子序列相同的miRNA为一个家族,所以常常我们看到一个microRNA家族是来自于不同染色体的原因!jiachengyou2007 http://www.targetscan.org ...

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【求助】紧急求助:信号转导阻断剂使用时,是否必须使用无血清培养基

wfn_1999 信号转导阻断剂使用时,是否必须使用无血清培养基?影响有多大chenlydd 因为血清中含有某些细胞因子,可能对你研究的信号通路有激活作用。chuckdouble wfn_1999 wrote:信号转导阻断剂使用时,是否必须使用无血清培养基?影响有多大A组使用阻断剂+含血清 B组使用阻断剂+不含血清 C组不含阻断剂 分组后测一下阻断率就知道了.doctormy 并不是必须使用无血清培养基,只要有平行对照即可本文由丁香园论坛提供 ...

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【讨论】线粒体RNA是否可以出线粒体膜

zhanglei0620202 :?)线粒体中的RNA是否可以到细胞质中或细胞膜中发挥调控功能或编码蛋白,有哪位达人做这方面的,关心过这方面,请指点迷津。freecell 线粒体含有少量的DNA和RNA,具有半自主性(能合成一部分蛋白质和酶)。其RNA可能只有在非正常生理状态或者病理状态下发生线粒体膜通透的情况下,才有可能进入胞质。个人观点,没有任何理论依据,仅供参考。zhanglei0620202 谢谢楼上的,我现在想找这 ...

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【求助】关于两个方法的翻译

luoqq1985 DNA Binding and Transcription Factor Pull-Down AssayArray Analysis of DNA-Binding Proteins请问这两个是什么方法?什么原理?谢谢,freecell Pull-down可译作“蛋白质下调”,基本原理是将靶蛋白-GST融合蛋白亲和固化在谷胱甘肽亲和树脂上,作为与目的蛋白亲和的支撑物,充当一种“诱饵蛋白”,目的蛋白溶液过柱,可从中捕获与之相互作用的“捕获蛋白”( ...

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【求助】异曲同工不同妙

guyan217 A能上调B基因,针对A基因设计了两条shRNA(1 和 2,分别针对ORF 和3'UTR ),都能有效敲低A基因(qpcr结果,引物扩增的是orf区),那么B基因理应都下调, 但是结果却只发现shRNA1转染的细胞B基因下调,shRNA2转染的细胞中没有变化。有经验的战友帮忙分析一下吧!zhujoker 机体是一个有缓冲能力的机体,不是说这个变化就一定能够引起另外一个变化,就如我们的血液一样,喝点醋不会说血液就成酸性了。A ...

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【求助】关于CHIP和CO-IP

foreach_no1 想请教下关于CHIP和CO-IP的问题1.我想知道这两个的区别是什么?我的理解前者检测蛋白和DNA,后者是检测蛋白和蛋白.不知道我这样说对不对?如果对的话,还有别的不同吗?!2.CO-IP我的原理我倒是明白了,但是关于实验的对照设计还有些问题,所以想请高手指点下3.CHIP我也是大致明白原理,不太知道实验要怎么设计.请大家指点!非常感谢哦!玉兔jane 我也想要知道roy2929 ChIP和Co-IP都是 ...

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【求助】请问在哪怎么找一个蛋白质的保守核苷酸序列

yanjiangwang 请问在哪、怎么找一个蛋白质的保守氨基酸序列?谢谢!jiwu20 ncbi比对之后就知道了,还有蛋白质数据库也可以。skly 这个,我还没有学到,帮忙顶一下!本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙伴师兄微信号:shixiongcoming

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【求助】人类基因组计划的样本采集是怎么样的?是在全世界范围内采集部分人的进行测序吗?

zjhua 请教下各位,人类基因组计划的样本采集是怎么样的?是在全世界范围内采集部分人的进行测序吗?freecell .....蒙特利尔大学的Bartha M. Knoppers法学及理学博士说,“例如,我们精心设计了社群参与和样本采集的策略,以确保不同人群中所有参与者都是在对本计划完全了解后才同意参加的."该研究science已经刊载。在methods里面应该可以找到方法。http://www.hku.hk/cpaoesite/ht ...

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【求助】如何实验证明一种分泌蛋白是自分泌作用还是旁分泌作用?

wbis 请教大家如何实验证明一种分泌蛋白是自分泌作用还是旁分泌作用?谢谢!zhujoker 我不知道你说的情况是什么样的情况,如果是养的细胞的话,那是不是不会出现这样的问题。如果是机体的话,你的这个问题就太复杂了,因为如果搞清楚了至少也是一篇10分的文章吧?如果要证明,也就只能是原代培养,分离组织挑单克隆培养细胞,然后进行鉴定了。单个细胞的话这个问题应该是能够解决了吧?索莱宝 唯一的方法就是免疫组化!董学易7235202 我 ...

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【求助】原核基因做真核表达的缘由?

gaohuairen 我做的原核生物 细菌。既然是原核基因,老板让我做真核表达,这还有什么意义?我一直想不明白原核基因做真核表达的意义何在,在此请教各位freecell 这个你应该问你老板。gaohuairen 我就是觉得老板他的想法可能有问题,老板是性情中人,一激动了,就让我这么做freecell wrote:激动和科学是两码事。顶着领导或者导师的帽子,就得承担那个责任。goooooodboy 你做的是什么细菌的基因?有的细菌致病是 ...

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【求助】急求电子书Cell Cycle Control: Mechanisms and Protocols

daiguo 求电子书Cell Cycle Control: Mechanisms and Protocols ,不胜感激!daiguo 怎么没人理我呢?bigben446 daiguo wrote:求电子书Cell Cycle Control: Mechanisms and Protocols ,不胜感激!http://www.uushare.com/user/vi1sun/file/1180008本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你 ...

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