【求助】关于鉴定基因isoform问题

我现在有个问题求助各位大侠：我想检测一个不太成熟的基因在不同组织的isoform,可是不知道采用什么方法呀？生物信息学方法能为我们提供什么帮助呢？
这个基因的其他物种的基因组序列尚未完全标注。
还有就是请问各位大侠，EST数据库应该如何用呢？
问题比较多，谢啦！

请各位大侠指点迷津，我的Email:hollyzyl@126.com

请问楼上的你所谓的“一个不太成熟的基因”到底其研究到达何种水平，其基因序列全部测出来了吗？还是有几种isoform没有搞清楚啊？其异构体的差异又在哪里没有清楚？还有就是你说的“这个基因的其他物种的基因组序列尚未完全标注”，到底他们之间有没有物种保守性呢？有的话就好办很多。
关于如何使用“EST数据库”，给你几篇中文的文献介绍，你自己看看就清楚很多了。
1、表达序列标签技术及其应用
2.三七根差异基因表达序列标签生物信息学分析
3.表达序列标签（EST）的研究现状
4.http://www.bbioo.com/bio101/2007/20990.htm

To zhujoker：非常感谢，人类的基因序列和其中一种异构体蛋白序列已经完成，至于有没有isoform和几种isoform都不知道；小鼠的DNA是知道的，但是在ncbi中显示小鼠的mRNA序列尚未完全标注，其他的物种DNA都没有测完，从DNA及ensembl预测的mRNA序列来看是比较保守的

但是作为最好转录出来的mRNA，既然他们为soform，那么他们的序列就有很多相似之处吧，既然有很多相似之处，你可以在确定的序列上通过上游或者下游苗式PCR扩增出序列，然后不是就可以测序鉴别了吗？
个人推理哈，你还需好好考虑！

我也想顺便问一下，我现在做的基因，文献上说有4种isoform，可是我怎么在NCBI上只找到一种mRNA呢，我现在不知道我应该扩哪个isoform做我下面的载体构建了，谢谢

我想再补充一下我的问题，这4种亚型的表观分子量知道，但是真的找不到它的具体序列啊