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【求助】小抽质粒浓度很低

lixingliang1987 本人最近小提质粒,挑取单克隆于3毫升LB培养基培养6小时候抽质粒,发现浓度只有50纳克每微升。后来重新挑取单克隆于10毫升LB培养基培养14小时,收集10ml菌液进行离心,裂解,上柱(10ml菌液只上一个柱子,量绝对足够了吧),结果浓度才300纳克每微升,我本计划下步做转染,如此低得浓度我很是担心啊不知道大家有没有遇到过此情况。我用的是pEGFP-N2质粒,是高拷贝的。PS:我怀疑是不 ...

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【求助】HCT116细胞是培养

淡墨留痕 我们最近在培养HCT116细胞,发现其状态不是很好,很容易扎堆生长,用胰酶消化的时候也是一团一团地被消化下来,很难把它们吹散成一个一个细胞。而且长得也挺快也挺不均匀的,传代的第二天,有些地方就长得满满的了。想请教一下这是为什么呢五月鱼 你好, 我养的细胞和你一样,消化下来也是一团的,但吹打以后就没有这样的情况了。建议你分皿前还是要吹匀,分皿后在镜下看一看,移动培养皿的时候尽量动作轻,避免晃动。tianyayangg ...

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【求助】空白载体转染后GFP发光情况

doctorchihlee 大家好,请问一下空白载体(含GFP,但不含靶基因)成功转染哺乳动物细胞后,荧光显微镜下观察GFP,观察到细胞全部呈绿色还是仅仅外周发光或是核发光?谢谢!doctorchihlee GFP在细胞质,是全部发光?!?real_madrid_146 这个是我用pEGFP-C2转HEK293的图。shylook 就是这样的济南基美 全部发光,GFP由于比较小,会有部分可以进入细胞核,有文献报道过本文由丁香园论坛提供, ...

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【讨论】质粒测序问题

lixingliang1987 本人近日构建克隆,送公司测序。得到序列结果进行DNAMAN分析,发现和目的基因相比多出两个碱基,我随后查看测序峰图,发现峰图上并没有相应的碱基,询问过公司后,他们建议按照峰图来分析结果。像这种拼接序列和峰图序列不同的现象,不知大家平时经常遇到吗?shylook 1.峰图有的 才能有 请确认是否真的没有多出俩碱基确认后打电话给公司 两边都打开峰图 确认一下如果确实没有 即声讨不负责任 不付款 找另外的公司再测2.真 ...

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【求助】基因入门书籍

程程880309 求各位:我是研一学生,因课题组的研究方向是关于microRNA,请问用哪本书比较好?谢谢各位啦~~负极兔 友情帮顶smilewei15 马上读研,现在的毕设也是这个方向~~同求~~本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙伴师兄微信号:shixiongcoming

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【求助】我设的6个时间点(15min-2day)能否满足Akt、PTEN变化研究?

ww_e00 我要研究Akt、PTEN蛋白在接受处理因素后的变化情况。参考一些帖子和文章,看到:5min-120min用于研究受体传递放大信号;2h-48h用于研究细胞接受信号后出现细胞周期变化、出现特定生物行为等。于是我设计了几个时间点:15min, 30min, 60min, 2h, 4h, 8h, 16h, 应该足够研究细胞接受处理后出现的短期长期变化情况了吧?fungicider 既然你查文献中是到48小时,为什么你设计的最长是到16小时?ww_ ...

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【求助】关于cDNA和mRNA的序列,有些混淆

drmine 假设某基因的DNA序列是:5'-GAACT-3'3'-CTTGA-5'问题一: 对 该DNA进行体外转录,得到的RNA序列是什么?问题二: 该序列对应的mRNA序列是什么?假设mRNA序列是5'-GUUCU,问题一:由该mRNA反转录得到的cDNA序列是什么?问题二: 针对该mRNA的siRNA序列,sense strand是什么?谢谢。lifz2001 1.到的RNA是5'-AGUUC3'基因组DNA在转录后经过剪切和拼接得到mRNA。 ...

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【求助】甲基化含量测定

bjx2325 请教,有什么比较好的办法对甲基化含量进行测定么,谢谢!shylook 1.Msp I和Hpa II联合酶切 后跑胶 根据片段长度变化 看总体甲基化变化2.CpG抗体3.甲基化敏感性高分辨熔解分析4.焦磷酸测序5.还可以用MBD珠子富集甲基化片段bjx2325 shylook wrote:1.Msp I和Hpa II联合酶切 后跑胶 根据片段长度变化 看总体甲基化变化2.CpG抗体3.甲基化敏感性高分辨熔解分析4.焦磷酸测序5.还可以用MBD珠子富集甲 ...

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【求助】非常棘手

0534130323 请求高手:实验中细胞受刺激之后一些相关细胞因子分泌增多,我用药物处理之后这些细胞因子分泌减少了。我往上追溯其作用机制,分别检测相关调控基因的蛋白表达和mRNA表达情况。结果发现药物只影响基因的蛋白表达,对其mRNA却没有影响。请问这该如何解释?霍一刀hxs 影响翻译而不影响转录,很正常的调控方式。0534130323 非常感谢whatisever 也可能只影响蛋白的稳定性。济南基美 降解被抑制了本文由丁香 ...

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【求助】友有没有什么能常温将RNA携带的方法

freezingfall 请问战友有没有什么能常温将RNA携带的方法,求具体处理步骤,不胜感激freecell 方法1: 利用INVITROGEN的RNALATER试剂保存RNA。Room-temperature storage (18–25°C) in RNAlater is possible for up to 7 days according to manufacturer’s instructions, although significant mRNA degradation was det ...

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【求助】植物基因组DNA PCR 出现弥散现象

人人都爱小勇哥 我提取植物基因组DNA ,并设计引物进行PCR反应,但是出现弥散现象,弥散部位很很亮,然后我进行胶回收,在切胶过程中切取较量部位,然后进行回收,电泳检测发现仍有弥散。不知道是怎么回事,希望各位高手给予指点,谢谢!!lifz2001 弥散原因很多,贴个图看看。体系?反应条件讲清楚?wangch84 降低引物浓度和模板投入量本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的 ...

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【求助】关于模拟磷酸化

zxsys123456 想要查阅有关模拟磷酸化方面的文献,有谁知道该怎么查?或者指点一下该怎么做突变?bigbang_0_0 突变成带负电荷的氨基酸,比如谷氨酸或天冬氨酸豆龟 zxsys123456 wrote:想要查阅有关模拟磷酸化方面的文献,有谁知道该怎么查?或者指点一下该怎么做突变?请问楼主,找到相关文献了吗?酪氨酸的磷酸化怎么模拟?本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为 ...

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【求助】3’末端切平

若水无涯 请问有谁做过3’末端切平啊?我要做平末端连接,先将目的片段通过限制酶进行酶切,可两端产生的都是3'突出末端,不知道该用那种酶进行切平比较好,看见有好多都是补平的体系,现不知道具体用哪个公司的那种酶效果会比较好,是个新手,谢谢了!sgc7901 neb不错,值得推荐。NEB 若水无涯 您好!您如果要做3‘端的切除,NEB有以下几种酶建议您可以考虑: DNA Polymerase I, Large (Klenow) Fragment and T4 DNA Poly ...

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【求助】miRNA如何构建到慢病毒载体

tutufei miRNA如何构建到慢病毒载体?与基因构建到质粒载体有何区别吗?最好有具体的实验步骤,或相关资料,不胜感激!大鹏鸟 本质上没啥区别的。步骤:1、设计好premiRNA----带有相应酶切位点2、化学合成3、退火形成双链4、连接到相应载体5、转化感受态,6、酶切或者PCR鉴定,测序7、扩增阳性质粒,包装慢病毒,进行细胞学实验。其实不建议自己构建miRNA慢病毒质粒,现在都已经商品化了,直接买来就可以用,既节约时间,又 ...

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【求助】如何提取核蛋白

viola2010 您好,我是新手,请问核蛋白如何提取?试剂盒那个公司较好?kkndd 不用试剂盒,这篇1989年的文章的方法,我们实验室现在还在用,非常有效,非常简单,Nucleic. Acids. Res. (1989) 17: 6419. (PMID: 2771659)这是一篇比较新的文章,用的也是那篇89年的方法,Mol. Cell. Biol. (2000) 20: 8783-92. (PMID: 11073979)xhjggl 上海生工的 BSP009shylook 很多kit都可以用呀 ...

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【求助】今天提的PUC18质粒直接电泳,请大家帮我看一下

zjf0709 左侧的是提取的PUC18质粒,中间的marker不太好(可以忽略),右侧的marker是DL2000,由于跑得时间过长所以marker跑散了,右侧DL2000最上面的一个条带是2000bp,PUC18的序列是2686bp,为什么会跑的比2000bp还快?这个现象正常吗?是不是超螺旋的问题?请大家帮忙解答,谢谢!!!zjf0709 自己顶一下,请大家帮忙看一看。济南基美 是超螺旋的质粒,所以跑的快。一条带,说明都是 ...

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【求助】关于miR的转染

happy0coral 哪位大侠能告诉我用pre-miR转染是属于瞬时还是稳定转染啊,另外是不是只要是转染就叫miRi啊sxj_fish 很多基因都是可以转染的 ,DNA也可以转染,还有SIRNA也是可以转染的芍药香 可以选用瞬时转染也可以选用稳定转染,不过现在microRNA的前体转染大多是瞬时的。转染只是实验方法,应用于多种核酸的转入。artneer pre-miRNA是属于瞬转,因为转染miRNA的成熟序列很多情况下效果 ...

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【求助】连接后转化什么都没长,自连对照也没有

zhangtt0530 各位,我做此连接两个月了,始终连不上,此图为连接产物跑电泳,第2道为pet32a载体单切自连,肉眼看出现两条带;第4道为载体与片段连接,在载体位置有一条带,下面还出现n条带,6道为载体单切回收,7道为载体双切回收,8道为片段双切回收。载体与片段摩尔比应该能保证在1:6-1:10之间,10μl连接体系,总DNA含量在60ng左右,用的NEB连接酶,双酶切用的takara酶,酶切回收用水洗脱,4℃连接2 ...

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【求助】老外回复邮件,其中的英文缩写看不懂,请大家帮一下好吗?

zhichunelan 邮件的内容如下: Please try S.Choi. I think that the PI moved to a university, although I am not 100% sure. I did EM work for them and Dr. Choi is the contact person. 请问其中PI是什么意思,课题组吗?EM work又是什么意思,是说的一部分工作吗?我以前是临床专业,现在刚刚开始涉猎分子细胞生物学方面的研究,各方面都有很多欠缺,希望大家多多帮忙。也希望有类似关于邮件翻译问题的 ...

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【求助】关于NF-kB信号通路

zhangdepu_410 有做出过或者是看到过关于NF-kB激活了,但是snail却被抑制的实验么?我最近做一个实验就出现了这样的结果,查了一些文献NF-kB都是激活snail的,让我很是困惑,希望大家帮帮我!感激不尽!paroxysm 1.检测的NF-kappaB是转录水平上的激活(EMSA等等)还是磷酸化形式的上调(WB),这里面有些不同。2.检测snail的负调控元件和抑制通路。zhangdepu_410 paroxysm ...

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