PCR扩增样本DNA的HLA基因片段
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一、PCR扩增体系
1. 1.0 uM 引物
2. 300 ng 待测样本基因组DNA
3. 2.0 U Taq多聚酶
4. 200 uM 各种dNTP
5. 用1×PCR缓冲液(10 mM Tris-HCl,pH8.3,50 mM KCl,1.5 mM MgCl2,0.01%明胶)调至总体积100 ul,并用50 ul 矿物油覆盖,防止水分蒸发。
二、PCR扩增程序
按下列条件扩增30个循环,此程序适用于Perkin-Elmer9600扩增仪,其他型号扩增仪也可以参考。
1. 检测DR3、5、6、8
预变性:94℃,5分钟
变性: 94℃,30秒
退火: 60℃,50秒
延伸: 72,℃40秒
2. 检测DR2
预变性:94℃,5分钟
变性: 94℃,30秒
退火: 62℃,50秒
延伸: 72℃,40秒
3. 检测DR1
预变性:94℃,5分钟
变性: 94℃,30秒
退火: 55℃,50秒
延伸: 72℃,40秒
三、PCR扩增产物的鉴定
此步骤是监测PCR扩增的结果,预先用2%琼脂糖和1×TBE制备凝胶,每100 ml 凝胶中加入10 ul 溴化乙锭(10mg/ml),用梳子形成约10 ul 的加样孔,让凝胶完全凝固。
1. PCR扩增完毕后,吸取10ul的PCR反应液,置另一扩增管中;
2. 加入1~2 ul 的加样缓冲液(4%蔗糖,0.05%溴酚蓝);
3. 20 V/cm 电泳;
4. 溴酚蓝移动7 cm 后停止电泳
5. 在紫外投射光下观察电泳结果并拍照。
PCR扩增后,电泳凝胶上应出现相应的PCR扩增产物条带。