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多池 ASO筛查PCR扩增的DNA

相关实验:利用等位基因特异性寡聚核苷酸同时检测多点突变实验

最新修订时间:

材料与仪器

从兴趣基因 PCR 扩增获得的 DNA
10 X T4 多聚核苷酸激酶缓冲液 ASO 工作液 T4 多聚核苷酸激酶 2 X SSC 变性溶液 TMAC 杂交溶液 TMAC 洗脱液
恒温槽 斑点-印迹设备 尼龙膜 Whatman 3MM 滤纸 真空烤炉 可封口袋 振荡水浴或杂交炉 Kodak Biomax MS 胶片 X 线片盒和增光屏

步骤

用32P 标记个体ASO la. 对于每个待标A S 0 , 准备下列标记反应: 0. 75jul H 2 O ; 1. OOjjJ 1 0 X T 4 多聚核苷酸激酶缓冲液; 5. OOjul Zpmol/L A S O 工作液; 3. OOmI10mCi/ml [y-32P] A T P ; 0. 25jul lOU/^1 T 4 多聚核苷酸激酶; 37°C 恒温槽孵育lh。 2a. 加 90^1水,混勻,稍做离心并收集试管底部溶液,马上使用或一20°C 保存。 32P 标 记ASO探针池 lb. 对于每个A S O 探针池,须确定探针池中A S O 的总皮摩数。注意探针池中A S O 的 总皮摩数对10mCi/ml [7-32P] A T P 的体积比值应为3. 3。调整第Ia步中总反应及 各反应组分的体积以保证该比值。 37°C 恒温槽孵育lh。 2b. 加 4 倍体积的水,混勻,稍做离心并收集试管底部溶液,马上使用或一20°C 保存。 3. 按制造商要求准备点杂交设备,如有必要,清洗相关设备。 4. 剪一块与点杂交设备大小相适应的尼龙膜。在干胶上做不对称标记以便于杂交后确 定方向。 5. 将膜漂浮于水面使其湿润( 膜应该立即湿润) ,然后浸没直至使用,以 2X S S C 溶液 部分充填一容器。 6.对于每个要杂交到膜上的样品,加 92jul变性液至8jlJ 兴趣基因的P C R 扩增产物( 最 多 11种不同产物)或多重P C R 产 物 ( 每一产物200ng) 中。振荡混匀。同时准备阳 性对照、阴性对照及P C R 反应对照( 即不含模板D N A )。 7. 放膜在点杂交仪垫板上,安装斑点杂交板。在载样前不要使用真空抽吸。 8. 当所有的样品都与变性液混匀后,对点杂交设备进行真空抽吸。所有样品全部加入 到对应的孔,避免膜上产生气泡。小心不要触摸或戳破过滤器。 9•在真空抽吸状态下,拿开点杂交设备的上层封盖,快速拿开杂交膜,并将膜上多余
的 液 体 用 Whatman 3M M 过 滤 纸 吸 干 。 10. 把 膜 置 于 含 2 X S S C 溶 液 容 器 中 5min,然 后 用 Whatman 3 M M 过 滤 纸 吸 干 。 1 1. 真 空 抽 吸 状 态 下 ,在 垫 板 上 覆 盖 一 张 塑 料 薄 膜 以 去 除 设 备 中 残 留 的 任 何 液 体 。 以 纸 巾 汲 取 其 他 任 何 可 见 液 体 。 12. 通过80°C 烤箱恒温孵育l h ,将 D N A 固定于膜上。 13•将膜在水中放置5min以上充分湿润,然后置于一'可封口袋、 Thpperware容器或杂交管。 14. 加适量的含32P 标 记 A S O 探针的T M A C 杂 交 液 ( 根据经验决定探针浓度,但应在 0. 03〜0. 15p m o l / m D 置每张膜上并密封容器。如有必要,可 根 据 “正常单体”加 > 2 0 倍过量的未标记的A S ◦ 以降低杂交背景。 15. 从袋中拿出膜并按照以下步骤剧烈搅动进行洗脱:室温,在 200mi (多张膜则需 1000m l ) T M A C 洗脱液中洗脱20m i n ,然 后 在 52°C 预 热 的 300m l T M A C 洗脱液 (多张膜则需1000m l ) 中洗脱20m i n 。如背景仍高,则 加 5m i n 的室温预洗脱步骤。 工6•将膜置于Whatman 3M M 过滤纸上吸干,室温下在X 线影像盒中对BioMax胶片曝 光 15min〜Ih0 支持方案条带化旧探针及复杂交 杂交膜可以事先用杂交的探针条带化并反复杂交多次,都取决于膜上DNA (包括 实验及对照DNA) 的量。如果信噪比值可有效判读阳性、阴性及空白对照的杂交信号, 同时膜上实验和对照D N A 的量相等,则可对实验结果进行分析。 附加材料( 基本方案;标V 的条目参见附录1) 杂 交 膜 ( 基 本 方 案 ) V T M A C 洗脱液,新鲜配制并预温至前次杂交温度15°C以上 流动水浴,水温为前次杂交温度15°C以上 1. 把杂交过的膜置于含300m l 预温T M A C 洗脱液的洗脱容器中。在前次杂交温度15°C 以上水浴中剧烈振荡洗脱l h 。 2 . 从水浴中取出杂交膜并在Whatman 3 M M 滤纸上吸干。 3 . 自显影以确定前次杂交探针已去除。 4 . 按上述步骤进行杂交或室温干燥保存杂交膜。可储存在能反复开启的袋子里

来源:丁香实验

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