农杆菌质粒DNA提取常规方法(不用试剂盒)
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一、从在含20 mg/l Kanamycin和15 mg/l Gentamycin 5-8 ml的液体LB培养基中接种Agrobacterium 细胞,然后在28℃、200-220 rpm培养24 h。然后进行质粒 提取。
二、新鲜配制Sol II溶液(880 µl H2O, 100 µl SDS 10%, 20 µl 10 N NaOH),及包含 4 mg/ml溶菌酶Lysozyme 的200 µl Sol I (P1)溶液。
三、对培养一昼夜的的Falcon试管在3600 rpm速度下进行离心12 min,丢弃上清。
四、用200 µl 5 M NaCl重悬农杆菌细胞,利用涡旋将农杆菌细胞混匀。转移到eppendorf 管中。
五、加入20 µl 10% N-Lauroylsarcosine sodium溶液,上下倒置6-8次混匀(从不同方向倒置)。
六、最大速度(13000 × g )下离心2 min,丢掉上清液。
七、用200 µl含4 mg/ml Lysozyme的Sol I (P1)(Sol I: 50 mM glucose, 25 mM Tris-Cl (8.0), 10 M EDTA (8.0))重悬沉淀,涡旋直至混匀。有时可用微量移液管头将其搅拌混匀。置于冰上。
八、加入400 µl Sol II (P2)(Sol II: 880 µl H2O, 100 µl SDS 10%, 20 µl 10 N NaOH),上下倒置6-8次混匀(从不同方向倒置)。在冰上放置5 min。
九、加入300 µl Sol III (P3),用手振荡。在冰上放置10 min。Sol III = Buffer P3, Neutrilization solution.
十、最大速度(13000 × g )下离心12 min。
十一、将上清液(700 µl)转移到新的eppendorf 管中。
十二、用1× 酚/氯仿(Phenol/Chloroforum,350 µl Phenol +350 µl Chlororum, “Choloforum” is 24 parts chloroforum and 1 part isoamylalcohol)抽提。在通风橱中,往eppendorf 管中加入酚和氯仿(氯仿加入时要动作迅速,否则会吸入微量移液器中)。涡旋15 s,最大速度(13000 × g )下离心2 min。将上层相(700 µl)小心移入新的Eppendorf管中。倾斜吸取,防止吸入下层的酚/氯仿。注意所有使用过的吸头都放入通风橱内的有毒拉圾箱内。酚/氯仿残留液倒入通风橱下面柜子里的酚/氯仿废液瓶中。
十三、用700 µl isopropanel沉淀,室温下放置5 min。
十四、最大速度(13000 × g )下离心15 min,小心除去上清。可分两步,先用大移液管移走大部分上清,剩余50 µl左右再离心5 min。注意沉淀小球并不一定牢固吸在管壁上,小心不要吸走沉淀。
十五、用70%酒精洗涤。加入1 ml 70%酒精,最大速度(13000 × g )下离心5 min,小心移去上清。室温下晾干。
十六、20 µl TE + 10 mg/ml RNase A重悬沉淀。在冷室放置一昼夜,后贮于-20℃冰箱。