HLAⅢ类基因区
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HLA Ⅲ类基因区
位于HLAI类和Ⅱ类区之间从PPIP9到BTNL2包含有62个基因座位．长度为0．9Mb。其中58个表达基因，2个假基因，每14 516bp就有一个基因，因此是整个基因组中基因密度最大的一个区域。除了LOCA01250基因外，其余基因均在1999年已发现。此外，在Ⅲ类基因区的表达基因中，有的产物发挥重要作用．如参与细胞转录调节(CREBLl、BTKl9、PBX2、RDBP、SKW2L、BATl和VARS2)、管家(DOM3Z、NEVI、AGPATl、CLICl和CSNK2B)、生物合成、电子转移、显示水介活性以及介导蛋白―蛋白间的相互作用中。以下是Ⅲ类基因区中的主要基因。
(1)补体基因：补体基因C2与月／基因相距极近，中间仅隔421bp，且二者有相似的内含子―外显子结构，可能是由同一组基因因重复而产生。C2与月／均具有多态性。用等电聚焦法至少可检出9个型别的C 2分子，其中最常见的为C2C。Bf在电泳中也具有明显的异质性，已发现的型别达20种以上。C2与月／表型及其基因频率在人种与地区间的差异十分显著。C4基因包括C4A和C 4B，分别编码补体的CAA和CAB蛋白，且两者高度同源(仅在1101～1106部位有4个氨基酸残基不同)。C4墓因有两个特点：一是C4长度可有变异：C4A通常为长基因(22kb)；C4B基因则有长(22kb)和短(16kb)两种形式。第二是存在高频率的无效基因，常用Q0(quantityzero)表示。C4基因的表达与否可能与自身免疫，睦疾病的易感陛有关。需要指出的另一点是，不同HLA单体型C4基因的数目可有不同，可能是减数分裂中同源染色体之间的不等交换所引起。
(2)21―羟化酶基因：2个21―羟化酶基因(CYP21A及CYP21B)位于C4A和C4B基因3，端3kb处，与C4基因约有97％同源性。CYP21B基因编码肾上腺21―羟化酶。约95％先天性肾上腺增生症(congenital adrenal hyperplasia，CAH)的致病原因是CYB21B基因缺失、突变或蛋白表达减少。
(3)热休克蛋白(HSP)基因：3个热休克蛋白基因位于Ⅲ类区域，称HSPML、HSPMA和HSPAlB，分别编码分子质量70kDa的热休克蛋白1样、IA和1B分子。这些基因的表达可在热休克时上调．并在蛋白的合成、折叠、组成和降解过程中发挥伴侣分子的作用。
(4)TNF、LTA和LTB基因：TNF基因的编码产物为TNF-a，由单核／巨噬细胞产生。LTA和LTB(1ymphotoxin，LT)基因编码的产物为淋巴毒素。及淋巴毒素p，淋巴毒素卢由T细胞产生。
晚近有学者建议将在Ⅲ类区域靠近端粒端的一些基因包括TNF、LTA、LTB、SHP等划归HLAⅣ类基因区或炎症基因区，以突出这些基因的功能及其与各种应急、感染及炎症反应的关系。
