HLA等位基因序列特异性探针(SSO)及其标记
互联网
2467
HLA 等位基因序列特异性探针(SSO)及其标记
(一)DRB1分型SSO探针
根据分辨率的要求选择。 常用的DRB1分型的SSO探针见表
代号
|
SSO探针的DNA序列(5’-3’)
|
DR特异性
|
L11
|
TTCAAACTTAAGCTGCCAC
|
DR1
|
D11
|
CTCATACTTATCCTGCTGC
|
DR2
|
N77
|
TCTGCAGTAGTTGTCCACC
|
DR3
|
H33
|
CTCTTGGTGATAGAAGTATC
|
DR4
|
E58
|
CCAGTACTCCTCATCAGGC
|
DR11
|
L37
|
AGCGCAGGAGCTCCTCCTG
|
DR12
|
G11
|
CTTATACTTACCCTGCCAC
|
DR7
|
L74
|
GTGTCCACCAGGGCCCGCC
|
DR8(+1403)
|
Y26
|
CTGTGCAGATACCGCACCC
|
DR9
|
V11
|
CTCAAACTTAACCTCCTCC
|
DR10
|
E71
|
GGCCCGCTCGTCTTCCAGG
|
DR13(1301,1302,1304)
|
|
|
DR1(0103)
|
|
|
DR4(0402,0414)
|
|
|
DR11(1102,1103)
|
K71
|
CGGCCCGCTTGTCTTCCAG
|
DR13-HAG(1303)
|
H60
|
GTTCCAGTGCTCCGCAGCA
|
DR14(1401,1404,1407)
|
N37
|
AGCGCACGTTCTCCTCCTG
|
DR3
|
|
|
DR13(1301,02,04,06)
|
|
|
DR14(1402,1403,1406)
|
D37
|
GAAGCGCAAGTCCTCCTCT
|
DR2(DRBundefined0101)
|
AV86
|
GCTCTCCACAGCCCCGTAG
|
DR2(DRBundefined02)
|
|
|
DR1(0102)
|
|
|
DR12
|
(二)SSO探针标记
SSO探针标记可以采用放射性同位素标记,也可采用非同位素表记。下面介绍的是采用T4噬菌体多核苷酸激酶将放射性同位素γ-32 P标记在SSO探针上。
【试剂配制】
(1) SSO探针(10pmol/L)
(2) 10XT4噬菌体多核苷酸激酶缓冲液:0.5mol/LTris-HCl(pH7.6);0.1mmol/L MgCl2;50mmol/L二巯苏糖醇(DTT);1mmol/L盐酸亚精胺;1mmol/L EDTA(pH8.0)
(3)[γ-32 P]ATP(比活5000Ci/mmol,10mCi/ml水溶液)
(4)T4噬菌体多核苷酸激酶
【操作步骤】
(1)配制标记反应混合液
SSO探针(10pmol/L) 1.0ul
10XT4噬菌体多核苷酸激酶缓冲液 2.0ul
[γ-32 P]ATP 5.0ul
ddH2 O 11.4ul
(3) 在上述反应混合液中加入8单位(约1ul)T4噬菌体多核苷酸激酶,充分混匀,置37℃温育45分钟;
(4) 温育完毕后,置68℃10分钟,灭活T4噬菌体多核苷酸激酶。
【注意事项】
(1) 标记后的SSO探针比活应达到2000Ci/mmol,如果比活性太低,可在标记反应中补加8单位T4噬菌体多核苷酸激酶继续标记。
(2) 上述标记的SSO探针可直接使用,也可以采用柱层析分离后使用。
(3) 放射性物质的操作应严格遵守有关规定和采取适当的防护措施。