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HLA等位基因序列特异性探针(SSO)及其标记

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HLA 等位基因序列特异性探针(SSO)及其标记
 
(一)DRB1分型SSO探针
    根据分辨率的要求选择 常用的DRB1分型的SSO探针见表
代号
SSO探针的DNA序列(5’-3’)
DR特异性
L11
TTCAAACTTAAGCTGCCAC
DR1
D11
CTCATACTTATCCTGCTGC
DR2
N77
TCTGCAGTAGTTGTCCACC
DR3
H33
CTCTTGGTGATAGAAGTATC
DR4
E58
CCAGTACTCCTCATCAGGC
DR11
L37
AGCGCAGGAGCTCCTCCTG
DR12
G11
CTTATACTTACCCTGCCAC
DR7
L74
GTGTCCACCAGGGCCCGCC
DR8(+1403)
Y26
CTGTGCAGATACCGCACCC
DR9
V11
CTCAAACTTAACCTCCTCC
DR10
E71
GGCCCGCTCGTCTTCCAGG
DR13(1301,1302,1304)
 
 
DR1(0103)
 
 
DR4(0402,0414)
 
 
DR11(1102,1103)
K71
CGGCCCGCTTGTCTTCCAG
DR13-HAG(1303)
H60
GTTCCAGTGCTCCGCAGCA
DR14(1401,1404,1407)
N37
AGCGCACGTTCTCCTCCTG
DR3
 
 
DR13(1301,02,04,06)
 
 
DR14(1402,1403,1406)
D37
GAAGCGCAAGTCCTCCTCT
DR2(DRBundefined0101)
AV86
GCTCTCCACAGCCCCGTAG
DR2(DRBundefined02)
 
 
DR1(0102)
 
 
DR12
 
(二)SSO探针标记
    SSO探针标记可以采用放射性同位素标记,也可采用非同位素表记。下面介绍的是采用T4噬菌体多核苷酸激酶将放射性同位素γ-32 P标记在SSO探针上。
【试剂配制】
(1)     SSO探针(10pmol/L)
(2)     10XT4噬菌体多核苷酸激酶缓冲液:0.5mol/LTris-HCl(pH7.6);0.1mmol/L MgCl2;50mmol/L二巯苏糖醇(DTT);1mmol/L盐酸亚精胺;1mmol/L EDTA(pH8.0)
(3)[γ-32 P]ATP(比活5000Ci/mmol,10mCi/ml水溶液)     
(4)T4噬菌体多核苷酸激酶
【操作步骤】
(1)配制标记反应混合液
    SSO探针(10pmol/L)              1.0ul
    10XT4噬菌体多核苷酸激酶缓冲液    2.0ul
    [γ-32 P]ATP                        5.0ul
    ddH2 O                             11.4ul
(3)     在上述反应混合液中加入8单位(约1ul)T4噬菌体多核苷酸激酶,充分混匀,置37℃温育45分钟;
(4)     温育完毕后,置68℃10分钟,灭活T4噬菌体多核苷酸激酶。
【注意事项】
(1)         标记后的SSO探针比活应达到2000Ci/mmol,如果比活性太低,可在标记反应中补加8单位T4噬菌体多核苷酸激酶继续标记。
(2)         上述标记的SSO探针可直接使用,也可以采用柱层析分离后使用。
(3)         放射性物质的操作应严格遵守有关规定和采取适当的防护措施。
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