小鼠药物干预后两种蛋白的磷酸化酪氨酸水平检测
丁香园
2532
小鼠XX细胞药物干预后两种蛋白的磷酸化酪氨酸水平检测
实验分组:小鼠XX细胞,按下面分组进行药物干预培养,并收集细胞进行免疫沉淀实验。
1 | 正常对照组 |
2 | 高糖组 |
3 | 高糖+E药物 |
4 | 高糖+A药物(25μM) |
5 | 高糖+A药物(50μM) |
6 | 高糖+A药物(100μM) |
7 | 高糖+A药物(100μM)+B药物(1mM) |
8 | 高糖+C药物(25μM) |
9 | 高糖+C药物(50μM) |
10 | 高糖+C药物(100μM) |
11 | 高糖+C药物(100μM)+B药物(1mM) |
12 | 高糖+D药物(25μM) |
13 | 高糖+D药物(50μM) |
14 | 高糖+D药物(100μM) |
15 | 高糖+D药物(100μM)+B药物(1mM) |
免疫沉淀过程
实验试剂:A抗体(santa cruz,IP浓度 1:100);B抗体(santa cruz,IP浓度 1:100);Protein A+G Agarose(上海维景生物)
蛋白样品的准备:1).对于10厘米细胞培养皿中的贴壁细胞,吸除细胞培养液,PBS洗涤一次,然后加入500微升至2毫升细胞裂解液裂解细胞。可以使用嘉美生物Western及IP细胞裂解液或各种RIPA裂解液等进行细胞的裂解。 2).对于组织样品参考贴壁细胞使用裂解液的比例进行裂解。 3).对于悬浮细胞,离心收集细胞后,PBS洗涤一次,然后参考贴壁细胞的裂解方法进行裂解。 注意事项:详细的裂解方法参考不同裂解液的详细使用方法。对于不同的培养器材,参考10厘米培养皿的裂解液的用量进行裂解。如果裂解获得的蛋白样品浓度过高,可以用裂解液或PBS适当稀释,如果蛋白样品浓度过低,在以后的裂解过程中宜适当减少裂解液的用量。
去除非特异性结合:1).取200微升至1毫升蛋白样品,蛋白量约为200微克至1毫克,加入约1微克和免疫沉淀时使用的IgG种属相同的普通IgG和20微升充分重悬的Protein A+G Agarose,4℃缓慢摇动30分钟至2小时。2).2500rpm(约1000g)离心5分钟,取上清用于后续的免疫沉淀。注意事项:所谓种属相同的IgG是指,例如后续免疫沉淀时用的是小鼠IgG,则在本步骤中可以加入normal mouse IgG,如无normal IgG可以加入其它不影响后续检测的其它mouse IgG类型的抗体。通过和normal IgG和Protein A+G Agarose的孵育,可以充分降低非特异性的结合,降低背景。
免疫沉淀:采用A蛋白抗体,B蛋白抗体沉淀蛋白。1).加入0.2-2微克用于免疫沉淀的一抗,4℃缓慢摇动过夜。 2).再加入20微升充分重悬的Protein A+G Agarose,4℃缓慢摇动1-3个小时。为方便后续的洗涤操作可以把加入充分重悬的Protein A+G Agarose的量调整为40微升。3).2500rpm(约1000g)离心5分钟,或瞬时高速离心,小心吸除上清,注意宁可留下少量上清也不能吸掉Protein A+G Agarose。4).用准备蛋白样品时的裂解液或PBS洗涤沉淀5次,裂解液或PBS的用量每次为0.5-1毫升。洗涤时离心条件和吸除上清的要求同上面的步骤C3。 5).完成最后一次洗涤后,去除上清,加入20-40微升1XSDS-PAGE电泳上样缓冲液Vortex重悬沉淀,瞬时高速离心把样品离心至管底。 6).100℃或沸水浴处理3-5分钟,取部分或全部样品可测定浓度或者用于SDS-PAGE电泳,暂时不用的样品可以-20℃保存。
Western blot检测
实验试剂:Phosphotyrosine抗体( Millipore, #05-321, 1:500);Goat Anti Mouse IgG+A+M(H+L)/HRP(ZYMED, #62-64201,1:40,000-100,000)
实验设备:① 电泳电源:Mini-PROTEAN 3 Elecreophoresis Cell,Mini Teans-Blot Module,and PowerPac Basic Power Supply (BIO-RAD,Catalog#165-3323);② 电泳仪及附件:Mini-PROTEAN 3 Elecreophoresis Cell (BIO-RAD,Catalog#165-3301);③ 电转仪及附件:Mini Teans-Blot Elecreophoresis Transfer Cell (BIO-RAD,Catalog#170- 3930);④ NC膜:PIERCE,Catalog#88018;⑤ 滤纸:Whatman,3MM CHR
实验步骤:略
实验结果:目的蛋白检测,取以上沉淀下来蛋白混合液处理后,每孔点样15ul。
注:SDS-PAGE凝胶浓度为12%;阳性条带以Gel pro4.0 版凝胶光密度分析软件进行分析,测其(integrated optical density)累积光密度参考值。(例如:1.33E+05=1.33×105)。
Lanes: | Lane 1 | Lane 2 | Lane 3 | Lane 4 | Lane 5 | Lane 6 | Lane 7 |
Rows | (IOD) | (IOD) | (IOD) | (IOD) | (IOD) | (IOD) | (IOD) |
p-A蛋白 | 19.415 | 79.179 | 81.869 | 64.923 | 64.544 | 38.742 | 76.364 |
样本NO | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 |
Lanes: | Lane 1 | Lane 2 | Lane 3 | Lane 4 | Lane 5 | Lane 6 | Lane 7 | Lane 8 |
Rows | (IOD) | (IOD) | (IOD) | (IOD) | (IOD) | (IOD) | (IOD) | (IOD) |
p- A蛋白 | 66.048 | 38.485 | 24.444 | 41.068 | 50.312 | 57.092 | 42.603 | 94.83 |
样本NO | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 |
Lanes: | Lane 1 | Lane 2 | Lane 3 | Lane 4 | Lane 5 | Lane 6 | Lane 7 |
Rows | (IOD) | (IOD) | (IOD) | (IOD) | (IOD) | (IOD) | (IOD) |
p- B蛋白 | 19.37 | 61.188 | 56.7 | 47.383 | 42.308 | 16.953 | 75.589 |
样本NO | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 |
Lanes: | Lane 1 | Lane 2 | Lane 3 | Lane 4 | Lane 5 | Lane 6 | Lane 7 | Lane 8 |
Rows | (IOD) | (IOD) | (IOD) | (IOD) | (IOD) | (IOD) | (IOD) | (IOD) |
p- B蛋白 | 70.891 | 38.042 | 43.421 | 29.656 | 64.184 | 25.98 | 41.653 | 77.76 |
样本NO | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 |