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【求助】关于promoter 活性问题及蛋白半衰期问题

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做的目的蛋白,用药物处理后蛋白水平明显增高,想在转录水平研究一下,药物处理后,相应的核转录因子受体与目的基因启动子序列上元件结合。做了报告基因载体想检测目的基因启动子活性,但做了几次基本没有变化,我想知道这是由于哪种原因造成的? 使用的EL4细胞做的转染,文献报道过的,都是使用这种细胞研究白介素5的启动子活性的。
我使用的启动子片段大小为-1275~+45,目前我怀疑可能我所用的启动子片段中可能含有某种抑制元件存在,从而抑制了药物处理后启动子活性的提高,缩短启动子片段来看一下能否有效果。有了解这方面的大侠请多给点建议,,谢谢
还有,我想做一下il5蛋白半衰期的研究,打算用CHX 处理,时间点不知如何设计?请大侠们帮忙@
tsfkyh wrote:
做的目的蛋白,用药物处理后蛋白水平明显增高,想在转录水平研究一下,药物处理后,相应的核转录因子受体与目的基因启动子序列上元件结合。做了报告基因载体想检测目的基因启动子活性,但做了几次基本没有变化,我想知道这是由于哪种原因造成的? 使用的EL4细胞做的转染,文献报道过的,都是使用这种细胞研究白介素5的启动子活性的。
我使用的启动子片段大小为-1275~+45,目前我怀疑可能我所用的启动子片段中可能含有某种抑制元件存在,从而抑制了药物处理后启动子活性的提高,缩短启动子片段来看一下能否有效果。有了解这方面的大侠请多给点建议,,谢谢
还有,我想做一下il5蛋白半衰期的研究,打算用CHX 处理,时间点不知如何设计?请大侠们帮忙@


1、你原来在哪个细胞株发现目的蛋白在药物处理后表达升高的,后面就用该细胞株来转染嘛!

2、还有一种可能:该基因调节受增强子的影响,增强子的位置可以离目的基因很远,而你的启动子序列中没有该增强子序列。

3、目的蛋白升高,转录水平不一定升高,有可能在其它阶段发挥作用,如转录后水平、翻译水平及翻译后水平(蛋白降解慢等)等。
1、你原来在哪个细胞株发现目的蛋白在药物处理后表达升高的,后面就用该细胞株来转染嘛!
不是,先用293T做的转染,启动子活性没有变化,后来又查文献,发现研究此基因启动子活性,都是用的EL4细胞做的转染。

2、还有一种可能:该基因调节受增强子的影响,增强子的位置可以离目的基因很远,而你的启动子序列中没有该增强子序列。
设计的启动子序列中包含该基因表达的所有的必须得元件(文献中报道过的)

3、目的蛋白升高,转录水平不一定升高,有可能在其它阶段发挥作用,如转录后水平、翻译水平及翻译后水平(蛋白降解慢等)等。
谢谢你的答复
tsfkyh wrote:

2、还有一种可能:该基因调节受增强子的影响,增强子的位置可以离目的基因很远,而你的启动子序列中没有该增强子序列。
设计的启动子序列中包含该基因表达的所有的必须得元件(文献中报道过的)


增强子不属于启动子序列,它可能存在离目的基因很远的地方。呵呵

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