【求助】关于一种蛋白western的问题
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我现在要做细胞色素C(cyt C)的western ,买的抗体型号是SC-13156,请问有人用这个抗体么?怎么样?我要做这个,蛋白预染marker要买多大的?就是要根据cyt C的蛋白大小而定。还有就是做cyt C一抗的稀释度是多少?请有经验的前辈高手指!!
没有做过cyt C,但是做过WB。每次买抗体,都有说明书,说明书会告诉你比如做WB时出现条带的大小,已经建议的WB稀释浓度。建议lz好好看看说明书。
1.抗体浓度:一般用说明书推荐的浓度稍稍高一点即可,如推荐1:1000,可用1:800;
哦,这个我知道,我现在主要是还做,同学都说实验失败就在于这个稀释的度,这个蛋白分子量很小,只有800多,都说跑不大出来,一般分子量都是1W多,请问分子量小的还可以用其他方法么?yangbxys wrote:
没有做过cyt C,但是做过WB。每次买抗体,都有说明书,说明书会告诉你比如做WB时出现条带的大小,已经建议的WB稀释浓度。建议lz好好看看说明书。
恩,谢谢~请问这个分子量很小是不是不大容易出图,只有800多,还有别的方法可以测出来么?
林杉201212 wrote:
1.抗体浓度:一般用说明书推荐的浓度稍稍高一点即可,如推荐1:1000,可用1:800;
分子量这么小,用的SDS-PAGE胶浓度大一点,15%,跑胶时间不用太长,看见溴酚蓝跑的分离胶的中或中下部就停了,marker应该有专门小分子量预染marker,你找试剂公司的人跟他们讲一下你的要求,一般他们会有合适推荐给你的。转膜条件得摸,可以先按照实验室经常用的转膜条件试一下,如果是实验室转膜的目的蛋白分子量比如40kd用2h,你可以用1个小时试一下,转完以后的SDS-PAGE胶可以放到考马斯亮蓝染液染一下,看看小分子量蛋白转的情况,一抗先按照说明书建议的最高浓度做,二抗按照你所在实验室一般使用的浓度用一下,ECL发光的时候先按照实验室常用的曝光时间看一下,如果片子出来没有东西,别着急,把曝光时间延长再试试,即使没有目的蛋白,曝光时间长的话杂带会出来,个人认为如果曝光时间很长比如10分钟或更长,杂带出来还没有目的条带,有可能是膜上面目的条带没有或者抗体不行,这个时候你那这个膜stripper处理然后做内参比如GAPDH,如果GAPDH出来条带了,那就是一抗的问题或者目的蛋白不在膜上。最好做的时候,能带个阳性对照,这个可以肯定是抗体的问题还是样品的问题。总之,自己慢慢摸条件查查资料别着急,多向实验室的技术人员咨询,查资料看看别人怎么做的。
谢谢,写得这么详细,我明白了许多~
yangbxys wrote:
分子量这么小,用的SDS-PAGE胶浓度大一点,15%,跑胶时间不用太长,看见溴酚蓝跑的分离胶的中或中下部就停了,marker应该有专门小分子量预染marker,你找试剂公司的人跟他们讲一下你的要求,一般他们会有合适推荐给你的。转膜条件得摸,可以先按照实验室经常用的转膜条件试一下,如果是实验室转膜的目的蛋白分子量比如40kd用2h,你可以用1个小时试一下,转完以后的SDS-PAGE胶可以放到考马斯亮蓝染液染一下,看看小分子量蛋白转的情况,一抗先按照说明书建议的最高浓度做,二抗按照你所在实验室一般使用的浓度用一下,ECL发光的时候先按照实验室常用的曝光时间看一下,如果片子出来没有东西,别着急,把曝光时间延长再试试,即使没有目的蛋白,曝光时间长的话杂带会出来,个人认为如果曝光时间很长比如10分钟或更长,杂带出来还没有目的条带,有可能是膜上面目的条带没有或者抗体不行,这个时候你那这个膜stripper处理然后做内参比如GAPDH,如果GAPDH出来条带了,那就是一抗的问题或者目的蛋白不在膜上。最好做的时候,能带个阳性对照,这个可以肯定是抗体的问题还是样品的问题。总之,自己慢慢摸条件查查资料别着急,多向实验室的技术人员咨询,查资料看看别人怎么做的。
这么小的蛋白可以考虑一下Tricine SDS PAGE,下面是nature的protocol
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