审核专家 | 赵玉洁博士
生理学 厦门大学
原理
PCR 产物可通过硅胶柱纯化回收,硅胶膜在高盐度缓冲液中可以结合 DNA,低盐度缓冲液或水可洗脱 DNA(硅胶膜表面的硅胶醇基团呈弱酸性,水化后带负电荷。当溶液中存在一定浓度的阳离子后,形成的阳离子电子桥能够中和 DNA 和硅烷醇基团之间的表面负电荷,从而使 DNA 牢固的吸附在硅胶膜表面。相反,处于低盐水溶液状态下时,由于硅胶膜的硅烷醇基团与 DNA 磷酸基团之间的静电排斥,硅胶膜释放 DNA)。
用途
聚合酶链式反应产物中通常会含有过量的引物、dNTP、酶等,这些会对后续核酸序列测定、酶切、载体构建等产生影响,通过 PCR 纯化回收可获取纯的 DNA 扩增产物。
材料与仪器
1.高压灭菌 ddH2O
2.小型离心机
3.水浴锅
4.高压灭菌 Ep 管
5.PCR 产物纯化回收试剂盒
步骤
1.在紫外投射仪或凝胶成像仪上,用刀片切取包含目的条带的琼脂糖凝胶并称重;
2.一般以 0.1g 胶加入 100μl 溶胶液的比例(具体根据试剂盒说明添加),按凝胶实际重量加入溶胶液,水浴锅中 55℃ 溶胶(期间可缓慢震动 Ep 管,将胶溶解完全);
3.回收试剂盒中会配有回收柱和废液管,将溶解好的溶液加入回收柱中,并将回收柱套入 2ml 废液管中;
4. 12000 r/min 离心 30-60s,去除废液;
5.将 500μl 漂洗液加入回收柱,并将回收柱重新套入 2ml 废液管中,12000 r/min 离心 60-90s,去除废液;
6.重复漂洗一次去除废液;
7. 12000 r/min 离心 2min,将回收柱套入高压灭菌后的 1.5ml Ep 管中;
8.向回收柱正中央的滤膜上滴加 20-30μl 洗脱 buffer 或高压灭菌 ddH2O,静置 5-15min;
9. 12000 r/min 离心 90-120s;
10. 将 1.5ml Ep 管中的回收产物再次滴入到回收柱中央的滤膜上,或向滤膜中央再加 10μl 洗脱 buffer 或高压灭菌 ddH2O,继续静置 5-15min;
11. 12000 r/min 离心 120s,1.5ml Ep 管中收集到的溶液即为纯化回收的 PCR 产物。
注意事项
1. 切取的包含目的条带的琼脂糖凝胶需称重,并按照试剂盒说明要求按比例添加溶胶液;
2. 溶胶需充分;
3. 回收管、ddH2O 要提前高压灭菌;
4. 为尽量提高回收率可以将回收产物再次过柱、离心。
常见问题
对于后续要进行核酸序列测定或酶切构建的 PCR 产物,最终溶解时需用高压灭菌的 ddH2O,盐离子缓冲液、Tris-HCl 会影响相关实验效率。
来源:丁香实验