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核酸序列是了解生物体结构、功能、发育和进化的出发点。国际上权威的核酸序列数据库有三个，分别是美国生物技术信息中心（NCBI）的GenBank ，欧洲分子生物学实验室的EMBL-Bank（简称EMBL），日本遗传研究所的DDBJ 。内容来源：广东药学院实验指导手册。

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简单序列重复区间 PCR

简单序列重复区间 PCR，英文名是 inter－simple sequence repeat PCR， ISSR PCR，SSR 在真核生物中的分布是非常普遍的，并且进化变异速度非常快。有时为了增加多态性，常常采用一个 SSR 序列和一个随机引物组成的引物对，这样就又获得了另一种与 SSR 相关的标记，这种标记一端可以锚定在 SSR 序列中，另一端则可以通过随机引物来筛选，同一个 SSR 序列引物与不同的随机引物组合，可以获得各种各样的组合，从而得到更多的多态性。目前，用于简单序列重复

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序列特性

进行数据库的相似性搜索

操作方法所属实验：蛋白定量技术

核酸序列分析

一、实验内容1. 使用Entrez或SRS信息查询系统检索人瘦素（leptin）的mRNA、基因组DNA、外显子和5’调控区（promoter）等核酸序列，连接提取该序列内容，阅读序列格式的解释，理解其含义；2. 使用BioEdit软件对上述核酸序列进行分子质量、碱基组成、碱基分布、序列变换以及限制性酶切分析等基本分析，并从BioEdit软件的“help”栏了解该软件的其它功能；3. 使用BioEdit软件对人瘦素（leptin）的mRNA序列进行可读框架分析；4. 使用NCBI

操作方法所属实验：核酸序列分析实验

问怎么把mRNA的ori序列替换成PET19 的ori序列

土井挞克树

先获得PET19的序列，然后在mrna中加入ori起始复制子，然后往后扩增。

实验问答1 回答247 围观

问靶向线粒体序列

土井挞克树

可以参考文章含线粒体靶向序列的载体及其构建方法和应用与流程

实验问答2 回答332 围观

【求助】关于序列标记

JaneyJuan 请教各位大侠：我现在手上有一个真菌的ITS序列，请问怎样标示其中的ITS1、5.8S rDNA、ITS2和18S rDNA区域？急~~~请高手帮忙！非常感谢~~ freecell 你是不知道用什么软件在已知的ITS上去标示这些区域，还是不知道“ITS1、5.8S rDNA、ITS2和18S rDNA区域”在你手头ITS上的具体位置，想知道怎么样找到这些区域在ITS上的位置

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环状序列 circular permutation

偶数T型噬菌体 DNA上的基因排列。如将噬菌体基因用 a， b， c……， x， y， z表示，则 DNA直链端部一个基因并不一定，排列如图(1 ）所示。因此其基因图实际如（ 2）所示是呈环状排列。这点除遗传学的方法外，用物理学的方法也可以证明。

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患病个体的序列扩增实验

目标序列在患者样本中存在非常低的拷贝，选用巢式引物用两个连续的循环进行聚合酶链反应（即 PCR) 的方法扩增。在许多情况下，编码序列以及内含子侧翼序列中间的间接供体/受体位限制区域是最容易发生突变的，限制在这些区域进行分析的方法是可取的。

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短串联重复序列的 PCR

短串联重复序列 (short tandem repeats, STR) 的 PCR，也称微卫星 DNA (microsatellites) 或简单重复序列 (simple sequence repeats, SSR) 的 PCR，它的重复序列很小，其核心序列只有 2〜6bp ，重复次数通常为 15〜30 次。STR 广泛存在于真核生物基因组的编码区和非编码区中，其中以 dA-dC、 dA-dA-dN、dC-dA 和 dA-dG 为核心序列的 STR 最常见，最早发现的 STR 是由 dT-dG

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核酸序列检索

1. 使用Entrez信息查询系统检索核酸序列BC060830和NM_000230，连接提取该序列内容，阅读序列格式的解释，理解其含义；2. GenBank数据库序列格式的FASTA序列格式显示与保存；3. 使用SRS信息查询系统检索核酸序列BC060830，连接提取该序列内容，阅读序列格式的解释，理解其含义；

操作方法所属实验：核酸序列的检索实验

随机序列库的纯化

实验所需「材料」、「试剂」、「耗材」具体见「其他」1. 寡核苷酸合成完毕后，去保护，从固相支持物上切下，然后将溶液冻干（在浓缩的氢氧化铵中），或者用 10 倍体积的正丁醇于 -70℃ 放置＞1h 将寡核苷酸沉淀出来。2. 制备一块变性的聚丙烯酰胺胶。3. 用 100～200 ul 的水或缓冲液（如 TE 缓冲液，pH 8.0）重新溶解冻干的或沉淀出的寡核苷酸，加入等体积的 2×上样染料。上样前将样品加热到 75℃ 热变性 5 min。每一 2 cm×2 cm×1.6 mm 的孔中加入约

操作方法所属实验：随机序列库的纯化实验

问共享基因序列

土井挞克树

大概率是不同的，单拷贝变异性太大，不同物种间相似度很低。

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问#拟南芥基因CDS序列#

huarenqiang5

借鉴一下这篇文章《基因家族分析-提取某个结构域的序列，对应的蛋白质序列和cds序列（1）》，很详细。

实验问答2 回答361 围观

【求助】测序结果分析：应该对比的序列是看max score 最大的那个序列，还是max ident最接近的序列

shaoyibo 请问BLAST测序结果后，应该对比的序列是看max score 最大的那个序列，还是max ident最接近的序列?有人说是max score 最大的那个序列，可是我发现有好几个同样分值的，到底该如何看测序结果？请大侠指教，十万火急，多谢了 lmnsmu 我认为首先看max score最大的序列，同样分值的好几个，说明你blast的序列可能是个保守序列，在同一类或家族的基因均有。你可以点blast的条形

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【求助】求助外显子序列

fangxiang2008 有高手能指点一下图片6个外显子的序列码？或指点一下在什么地方能查到？图来源的文献在附件。 fangxiang2008 文献来源，刚才没有贴上去 zhujoker 你直接将基因说出来不就搞定了吗？NCBI你查相应的东西都有的。 bigbang_0_0 ucsc fangxiang2008

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序列特异性引物 PCR

序列特异性引物 PCR，英文名是 sequence specific primer， PCR－SSP，是基于核酸序列识别的方法。PCR－SSP 方法是设计出一整套等位基因组特异性引物，借助 PCR 技术获得 HLA 型别特异的扩增产物，通过电泳直接分析带型决定 HLA 型别，从而大大简化了实验步骤。优点是简单易行，分辨率可从低到高，成本低。缺点是不易自动化，不能检测新的等位基因，试剂盒需不断升级，合成多对 HLA 等位基因特异性的引物一次性投资较大。此方法适宜零散和纯度低样本，重复实验时要重提

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核酸序列分析实验

针对核酸序列的分析就是在核酸序列中寻找基因，找出基因的位置和功能位点的位置，以及标记已知的序列模式等过程。内容来源：广东药学院实验指导手册。

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序列比对

序列比对是比较基因组分析中的一项常规分析，目的是分析序列间的差异，获得序列间的相似度、相似区段等信息，为推断序列的功能、结构和进化等方面的信息提供参考。

操作方法所属实验：比较基因组常用分析方法

序列特异性引物 PCR

序列特异性引物 PCR，英文名是 sequence specific primer， PCR－SSP，借助 PCR 技术获得 HLA 型别特异的扩增产物，可通过电泳直接分析带型决定 HLA 型别，从而大大简化了实验步骤，具有简单易行的优点，分辨率可从低到高，成本低，在 HLA 分型中得到了广泛应用。

操作方法所属实验：序列特异性引物 PCR