【求助】测序结果分析:应该对比的序列是看max score 最大的那个序列,还是max ident最接近的序列
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请问BLAST测序结果后,应该对比的序列是看max score 最大的那个序列,还是max ident最接近的序列?有人说是max score 最大的那个序列,可是我发现有好几个同样分值的,到底该如何看测序结果?请大侠指教,十万火急,多谢了
我认为首先看max score最大的序列,同样分值的好几个,说明你blast的序列可能是个保守序列,在同一类或家族的基因均有。你可以点blast的条形图,从上到下详细去了解。一点拙见,希望对你有帮助。
我个人认为首先你要知道你做的是什么,也就是说做的已知基因还是未知基因。如果做的未知的话你可以首先考虑max score最大的序列,问问题时希望LZ把前后说的清楚一点,这样才会有更多的人参与讨论获取帮助。
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