简单序列重复区间 PCR
别名：
inter－simple sequence repeat PCR，ISSR PCR
最新修订时间：
简介
简单序列重复区间 PCR，英文名是 inter－simple sequence repeat PCR， ISSR PCR，SSR 在真核生物中的分布是非常普遍的，并且进化变异速度非常快。有时为了增加多态性，常常采用一个 SSR 序列和一个随机引物组成的引物对，这样就又获得了另一种与 SSR 相关的标记，这种标记一端可以锚定在 SSR 序列中，另一端则可以通过随机引物来筛选，同一个 SSR 序列引物与不同的随机引物组合，可以获得各种各样的组合，从而得到更多的多态性。
目前，用于简单序列重复区间 PCR 的方法主要有 1 种：ISSR－PCR 技术。
原理
在真核生物基因组中均存在着由 1~4 个碱基对组成的简单重复序列又称之为微卫星（microsatellite）E，如 （GA）」、（AC）」、（GAA）」等。同一类微卫星 DNA 可分布在整个基因组不同位置上，由于其重复次数不同或重复程度不完全而形成每个座位的多态性。SSR 两端有一段保守的 DNA 序列，通过这段序列可以设计一段互补序列的寡聚核苷酸引物，对 SSR 进行 PCR 扩增，由于 SSR 多态性仅由简单序列的重复次数的差异引起的，通常表现为共显性。
应用
简单序列重复区间 PCR 的常用应用领域如下：
（一）遗传作图与基因定位
（二）亲缘关系和遗传多样性的研究
（三）分子标记辅助育种
来源：丁香实验团队
操作方法
ISSR－PCR 技术，英文名是 inter－simple sequence repeats－PCR，是在 SSR 的基础上发展起来的一种新型的分子标记，是于 1994 年创建的一种简单序列重复区间扩增多态性分子标记。它的生物学基础仍然是基因组中存在的 SSR。ISSR 标记根据植物广泛存在 SSR 的特点，利用在植物基因组中常出现的 SSR 本身设计引物，无需预先克隆和测序。用于 ISSR－PC
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