土井挞克树
为了准确判断细胞是否有支原体的污染,待测的细胞培养液样品需要取自换液后培养2-3天且汇合度在90%左右的细胞培养液上清(贴壁细胞)。悬浮培养的细胞也需要在换液传代后,让细胞生长2-3天再取培养液进行检测
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实验步骤:
收集样本:从培养的乳腺癌细胞中提取DNA,同时准备一份支原体阳性对照样品和一份无模板对照样品。
设计引物:使用支原体特异性引物,可以设计一对PCR引物,用于扩增支原体16S rRNA基因。可以使用已发表的文献或公共数据库(如NCBI)中的序列信息来设计引物。
PCR扩增:设置PCR反应体系,包括PCR引物、模板DNA、反应缓冲液和聚合酶等。进行PCR扩增,通常可以使用以下程序:95℃预变性2min,95℃变性30s,56℃退火30s,72℃延伸1min,循环30-40次,最后72℃延伸5min。反应结束后可以进行凝胶电泳,观察PCR产物。
检测PCR产物:使用凝胶电泳检测PCR产物,支原体16S rRNA基因的PCR产物约为1500bp。如果样品中存在支原体DNA,则应该能够在PCR产物中检测到相应的条带。如果没有条带,说明该样品中不存在支原体DNA。
阳性对照:如果对照样品的PCR结果为阳性,则说明PCR反应体系有效,但并不能说明样品中存在支原体。因此,需要使用支原体阳性对照样品进行验证。
负性对照:如果无模板对照样品的PCR结果为阴性,则说明PCR反应体系没有受到污染。如果无模板对照样品出现条带,则说明PCR反应体系受到污染,需要重新进行实验。
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