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Snpstats最近能用吗?

相关实验:基于 SPSS 的卡方检验

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皮肤萌新

为什么到第二步,有SNP识别不了呢?也没法计算,太难了……

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3 个回答

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土井挞克树

有帮助

可以正常使用的,SNP使用不了,可能是你输入不对

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huarenqiang5

有帮助

可以用,是不是你操作或设置的问题。试试在运行时加入--create-output-bam-index false 选项,不让它创建bam文件的索引文件。然后自己给bam文件创建索引。

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loveliufudan

有帮助

如果在使用 SnpStats 过程中,遇到了 SNP 无法识别或无法计算的问题,可能有以下几个原因:

数据格式不符合要求:SnpStats 通常要求输入数据的格式为 PLINK 格式或者 PED/MAP 格式,如果数据格式不符合要求,则可能无法正确识别 SNP。

数据中存在缺失值或异常值:在进行 SNP 数据的分析时,如果数据中存在缺失值或异常值,可能会导致一些 SNP 无法被正确识别或计算,因此需要进行质量控制。

版本兼容性问题:SnpStats 更新较快,可能存在版本兼容性问题,需要注意软件包和软件版本的兼容性,如果软件包和软件版本不匹配,可能会导致无法正确识别 SNP。

如果您遇到了 SNP 无法识别或计算的问题,建议您可以尝试进行数据质量控制,检查数据格式是否符合要求,并查看软件包和软件版本是否匹配。同时,可以查阅 SnpStats 的相关文档和帮助文档,寻找解决方法。

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