请问影响蛋⽩质谱鉴定成功与否有哪些因素?

影响蛋白质谱鉴定成功与否的主要因素包括:

1. 样本准备:样本的提取、处理、解蛋白是否标准化,杂质是否充分去除,会影响后续鉴定效果。

2. 色谱分离:是否获得良好的色谱图,峰形是否对称分离清晰,分辨率是否足够。这决定了质谱的质量。

3. 质谱采集参数:扫描范围,碎裂能量,采集时间等参数设置是否优化,直接影响获得的质谱图质量。

4. 数据库搜索:选择合适的数据库,设置正确的搜素参数,会影响结果的可靠性。

5. 蛋白质组学实验技能:操作每个步骤的熟练程度,对结果有很大影响。

6. 仪器性能:质谱仪的灵敏度、分辨率、质量精度等技术指标也是关键因素。

7. 生物学复杂性:样本组成的复杂性决定鉴定难易程度。

8. 研究目的:是否需要定量,定量的技术手段等也会影响结果。

综合各方面因素,优化实验方案,才能提高蛋白鉴定的成功率。这需要研究人员的经验与技能。

与蛋白质肽链氨基酸的排列、分子量，以及二硫键数目和位置有关

影响质谱结果的一般因素有以下情况:

质谱鉴定不成功主要分为两类。 一个原因是质谱无效，另一个是没有参考数据的蛋白质数据库。 导致质谱结果不成功的原因可细分为：（1）蛋白点过浅，蛋白含量过低； (2)蛋白点太小，不利于操作； （3）虽然用二维电泳分离，但重点是几种蛋白质的混合物； (4)蛋白水解和质谱误差。