用流式细胞仪或者荧光显微镜，判定水样中藻类的死亡和存活藻，用什么染料

可以用Nile Red荧光染料对藻类进行分选。

可以使用合适的核酸荧光染料如SYBRGreen I， SYTOX Green I等。

对于判定水样中藻类细胞的死亡和存活状态，您可以考虑使用以下染料和方法：

1. 邻苯二酰亚胺（Sytox® Green）：这是一种核酸染料，可以进入损伤的细胞膜并与死亡细胞中的DNA结合，发出绿色荧光信号。使用荧光显微镜或流式细胞仪配合观察和分析，可以区分存活和死亡藻类细胞。

2. 荧光素酮酸酯（CFDA-SE）和细胞膜渗透染料（如PI）的组合：CFDA-SE可以进入细胞并转化为绿色荧光素酮，用于标记存活细胞；而PI只能进入破损细胞膜的死亡细胞，发出红色荧光信号。这种组合可以通过荧光显微镜或流式细胞仪同时观察和分析细胞的存活和死亡状态。

当涉及到细胞计数、分选和分析死活状态时，使用同一种染料叠加的方法可能较为困难。通常，分选需要单个细胞的信息，而死活状态的判断需要分析细胞的特定荧光信号。因此，建议您在实验中使用不同的染料或方法来完成细胞计数、分选和死活状态分析的目标。

您提到的ImageStream量化成像分析流式系统可以结合流式细胞仪和荧光显微镜的功能，提供高分辨率图像和多参数分析的能力。您可以根据具体实验需求和设备功能，选择适合的染料和方法来进行细胞计数、分选和死活状态分析。

采用染料SYBRgreen和碘化丙啶(PI)双染色判定细胞死/活的流式细胞仪分析方法