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请问单倍型能用indel做吗

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dxy_upgod9c3

indel数量太多了 想用LD缩小下范围

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3 个回答

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loveliufudan

有帮助

在研究单倍型时,indel可以被用来缩小单倍型分析的范围。例如,您可以使用indel标记作为单倍型分析的起点和终点,通过LD分析等方法来缩小单倍型的范围。

但需要注意的是,indel的分析需要考虑到其在不同基因组区域的频率和特征,因此需要对其进行针对性的分析和处理。另外,indel分析也需要充分考虑分析工具的准确性和灵敏度,以保证结果的可靠性。

因此,建议您在使用indel进行单倍型分析时,充分了解相关分析工具的使用方法和特点,以及indel在分析过程中的考虑因素,确保分析结果的准确性和可靠性。

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sswei

有帮助

能够直接进行单倍型的分析,且针对小的indel也有非常高的准确性。二代无法做单倍型的分析,唯一能做的单倍型的地方是在群体研究里面借助群体的数据推断个体的单体型。而ONT虽然也可以做单倍型分析,但其因为错误率问题对于小的indel准确率是比较差的。

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土井挞克树

有帮助

可以的,可以做多个单倍体缩小数量

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