材料与仪器
核酸
dNTP MnCl2 MgCl2 BSA rTth DNA聚合酶
水浴锅 培养箱
dNTP MnCl2 MgCl2 BSA rTth DNA聚合酶
水浴锅 培养箱
步骤
1. 用过氧化物酶,蛋白酶K和DNA酶预处理载玻片。
2. 配置如下一步反应体系(总体积100 μl)
2. 配置如下一步反应体系(总体积100 μl)
(1)0.5 μl 100 μmol/l 正向引物(终浓度0.5 μmol/l)
(2)0.5 μl 100 μmol/l 反向引物(终浓度0.5 μmol/l)
(3)6 μl 3 mmol/l 4dNTP混合物(终浓度0.12 mmol/l)
(4)2 μl 10 mmol/l MnCl2(终浓度0.2 mmol/l)
(5)10 μl 25 mmol/l MgCl2(终浓度2.5 mmol/l)
(6)2 μl 10×rTth 转录缓冲液(终浓度0.2×)
(7)8 μl 10×螯合缓冲液(终浓度0.8×)
(8)10 μl 1.7 mg/ml BSA(终浓度0.17 mg/ml)
(9)2 μl 2.5 U/ml rTth DNA聚合酶(终浓度9.05 U/ml)
(10)29 μl DEPC处理过的水
3. 用20 μl 吸头加8 μl(如用3孔载玻片)或12~20 μl (如用单孔载玻片)原位PCR扩增体系于各孔上,该液体覆盖整个孔表面。
4. 放20 mm×60 mm 盖玻片于每一载玻片上,小心用指甲油封住盖玻片边缘。
4. 放20 mm×60 mm 盖玻片于每一载玻片上,小心用指甲油封住盖玻片边缘。
5. 在92℃加热块上,温育玻片90 s。然后转至热循环仪。
6. 用步骤2所配一步反应体系代替原位PCR反应体系。
6. 用步骤2所配一步反应体系代替原位PCR反应体系。
7. 按如下温度循环程序进行反转录:
(1)1个循环:15 min,70℃
(2)3 min,92℃
(3)15 min,70℃
(4)3 min,92℃
(5)15 min,70℃
8. 按如下温度循环程序进行原位PCR:
(1)29个循环:1 min,93℃(变性)
(2)1 min,53℃(退火)
(3)1 min,72℃(延伸)
(4)最后一步:不定,4℃(维持)
9. 由热循环仪上取下载玻片,浸于100%乙醇中≥5 min 溶解指甲油,用剃须刀或其他小刀橇开盖玻片,刮去残留的指甲油,以便在杂交/检测步骤中能平放上新的盖玻片。
10. 在92℃加热块上温育玻片1 min,然后于室温下用2×SSC浸泡5 min。玻片在4℃可存敢2~3周。
来源:丁香实验