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TaqMan荧光探针和SYBR Green荧光探针更准确。
SYBR Green I是一种结合于所有dsDNA双螺旋小沟区域的具有绿色激发波长的染料。在游离状态下,SYBR Green I发出微弱的荧光,但一旦与双链DNA结合后,荧光大大增强。因此,SYBR Green I的荧光信号强度与双链DNA的数量相关,可以根据荧光信号检测出PCR体系存在的双链DNA数量。SYBR Green I 的最大吸收波长约为497nm,发射波长最大约为520nm。最大激发波长454nm。
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SYBR是非特异性的荧光染料,不能识别特定的双链,只要是双链(包括非特异性扩增产物、引物二聚体等)就会结合发光,在临床上使用可能会有假阳性发生。但该方法容易建立实验体系,可进行熔点分析,通用性好,价格相对较低,在科研中使用比较普遍。TaqMan 检测到的是积累荧光,随着循环数的增加,释放出来的荧光基团增加,特异性较强,可进行多重qPCR分析,但成本较染料法要高一些,实验构建相对复杂
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根据反应需求选择,一般荧光定量对扩增片段有较高的要求,一般为100-300bp;普通定量可以扩增长点的片段,如果不需要检测产物分子量大小,荧光定量可以不进行电泳就对产物进行定量分析
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