为什么通过elisa、WB能检测到的蛋白在itraq实验中没有检测到？

质谱不是专一性检测的，而是选择样品中丰度较高的蛋白质优先检测，而丰度较低的蛋白质则因为肽段信号过弱被淹没而不能被检测到。因此，如果样品中待检测的目标蛋白质丰度较低（或者蛋白质分子量较小），即使 WB 能够检测到，质谱并不一定能检测到

很正常的，因为elisa和wb的特异性还是比较好

人血浆中的蛋白是有上万种的，而一般质谱只能检测到五六百种，也就是说只占了其中的百分之几，这是普遍现象，说明咱们的方法是不存在问题的；

其次，ELISA/WB与质谱相对来说灵敏度不一样，前者具有放大效应，因为其间会用到相应的抗体，所以只要选对抗体，感兴趣的蛋白基本都会被检测到；

因此， ELISA/WB检测到的蛋白在组学中没有被检测到也是正常的。