土井挞克树
石蜡切片提取rna步骤:
1. 请自行准备:无水乙醇、生理盐水、二甲苯及无RNA酶1.5mL离心管。
2. 取出析出液和洗涤液,按以下操作:a) 析出液:4.5mL加入25.5mL无水乙醇,混匀;9mL加入51mL无水乙醇,混匀。
b) 洗涤液:9mL加入21mL无水乙醇,混匀;18mL加入42mL无水乙醇,混匀。
c) 配制好的析出液及洗涤液如出现沉淀,可在37℃溶解,摇匀后使用。
3. 样本处理:a) 取5-8 μm 厚石蜡切片5-10张,60℃放置5分钟,放入装有二甲苯的玻璃瓶中,浸泡10分钟后,用手术刀或刀片,将组织刮下,放入1.5 mL离心管。也可将石蜡切片60℃放置5分钟后,直接放入含1.2 mL二甲苯的1.5 mL离心管,震荡脱蜡10分钟,12,000 rpm室温离心2 min,弃上清。 b)石蜡块:手术刀刮取20-30 mg石蜡包埋组织样本(尽量去除石蜡部分),放入1.5 mL离心管,加入1 .2mL二甲苯,震荡脱蜡10分钟,12,000 rpm室温离心2 min,弃上清。
4. 在上述处理过的脱蜡样本管中加入1.2 mL 无水乙醇,旋涡震荡30 秒,12,000 rpm 离心 2分钟,弃上清(注意不要倒掉沉淀,少量乙醇可用吸水纸吸去,未包蜡样本不需此步)。
5. 开盖,室温放置5分钟,去除残留无水乙醇。
6. 加入100 μL生理盐水,震荡混匀20秒;加入200 μL裂解液,20μL消化液A,振荡混匀,室温放置5分钟。
7. 加入20 μL消化液B,震荡混匀,56℃水浴90分钟至组织完全消化裂解。(最好消化至溶液中无组织碎片,皮肤、肺脏、子宫等结缔组织较多的切片应适当延长消化时间。)
8. 加入500μL析出液,轻轻颠倒混匀,如有半透明悬浮物,不影响RNA的提取与后续实验。
9. 将吸附柱放入收集管内,将混合物吸入吸附柱内,静置2分钟,12,000 rpm 离心1分钟,弃收集管内废液。
10. 将吸附柱放回收集管内,加500 μL洗涤液至吸附柱内,静置2分钟,12,000 rpm 离心1分钟,弃收集管内废液。
11. 将吸附柱放回收集管内,12,000 rpm离心2分钟,离去残留的洗涤液。
12. 取出吸附柱,放入新的1.5 mL 离心管内,加入50-100 μL 洗脱液,静置3分钟,12,000 rpm 4℃离心2分钟,收集RNA溶液。提取的RNA即可用于下一步实验或-70℃保存。
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以下是石蜡切片提取RNA的方法:
材料:
RNase AWAY或其他RNase去除剂
DEPC水
70%乙醇
石蜡切片
无菌镊子
1.5 ml离心管
RNase-free聚丙烯酰胺凝胶
RNase-free试剂盒(例如,Qiagen RNeasy Mini Kit)
步骤:
使用RNase AWAY或其他RNase去除剂将刀片和所有工具清洗干净,以避免RNA的降解。
在DEPC水中漂洗石蜡切片,去除石蜡。重复2-3次。
将石蜡切片用无菌镊子移动到一个1.5 ml离心管中。
加入200-300 μl的DEPC水,加热至95℃,使石蜡切片融化。
加入等体积(200-300 μl)的苯酚/氯仿混合液,摇晃离心管混合10-15秒,离心3-5分钟,将上清移至新的离心管中。
加入1体积(200-300 μl)70%乙醇,混合离心,离心3-5分钟,将上清倒掉。
空气干燥石蜡切片,然后将其放置于RNase-free聚丙烯酰胺凝胶上。
加入适量的RNA提取试剂(例如,Qiagen RNeasy Mini Kit),按照试剂盒说明书提取RNA。
注意事项:
所有材料和工具都应为RNase-free。
加热过程应该快速,以防RNA降解。
RNA提取试剂的种类和用量应根据实验要求而定。
Dr_劉医生
石蜡切片提取RNA的方法可以使用以下步骤:
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