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从RNA中提取mRNA的方法

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4006

采用Promega公司的PolyATract® 26reg;mRNA Isolation System III。

使用该试剂盒,mRNA产量极低,因此下述方法是以Promega公司试剂盒操作手册为基础,并采用储昭晖硕士(作物遗传改良国家重点实验室植物分子生物学水稻分室)所建议的改进方法综合而成。

由使用者自备的材料

65℃水浴

无菌的、无RNase的1.5ml塑料离心管

无菌的、无RNase的加样枪和枪头

操作步骤

1. 探针的退火

① 在一个无菌的、无RNase的离心管中,加入未稀释的总RNA溶液,使终体积达到1.5ml。可使用更大量的总RNA,其浓度可至过饱和,即有絮状RNA沉淀析出,但当有絮状RNA沉淀存在时,后续的退火反应操作会受到一定程度影响;也可使用更少量的总RNA(50ug),但mRNA产量可能无法保证。

② 将离心管置于65℃水浴中10分钟或略长时间。

③ 加入15ul 的Biotinylated-Oligo(dT)探针和39ul的20%×SSC到RNA中。颠倒数次以混匀,静置于室温下至充分冷却。这将需要10分钟或略少的时间。在该溶液冷却期间,制备0.5%× 和0.1%×SSC贮存液

2. 贮存液制备

① 通过在三个无菌的、无RNase的离心管中各自混合30ul的20%×SSC和1.170ml的无RNase的水来制备三份1.2ml的无菌的0.5%×SSC。

② 通过在三个无菌的、无RNase的离心管中各自混合7ul的20%×SSC和1.393ml的无RNase的水来制备三份1.4ml的无菌的0.1%×SSC。

3. 链霉抗生物素蛋白-磁珠(Streptavidin-Paramagnetic Particles)的漂洗

① 取三管链霉抗生物素蛋白-磁珠,轻弹离心管的底部使SA-PMPs重悬直至其充分分散,吸取悬液合并于一管。

② 使汇总的SA-PMPs重悬直至其充分分散,然后将离心管置于磁柱中直至SA-PMPs已经聚集在离心管壁上(大约30秒)。小心地移出上清。不要离心沉淀颗粒。

③ 用0.5%× SSC漂洗SA-PMPs三次(每次0.9ml),每次都使用磁柱来捕获它们,然后小心地移去上清。

4)重悬漂洗过的SA-PMPs于0.3ml的0.5%×SSC中。

4. Oligo(dT)-mRNA退火杂合体的捕获和漂洗

① 将退火反应的全部成分加入到含有漂洗过的SA-PMPs的离心管中。

② 室温下静置10分钟。每1-2分钟轻柔地颠倒一次以混匀。

③ 用磁柱捕获SA-PMPs,小心移去上清,注意不要搅动SA-PMPs颗粒。当总RNA为过饱和高浓度时溶液时,退火反应易形成黑色絮状物,磁柱吸附也难以压缩其体积,这时应小心吸取上清;保留上清直至确信mRNA的结合与洗脱已是令人满意。

④ 用0.1%×SSC(每次0.9ml)漂洗颗粒4次,其间轻弹离心管底部直至颗粒已被重悬。最后一次漂洗后,在不搅动SA-PMPs的前提下,以8000rpm离心1分钟,尽可能多地移出液相。

5.mRNA的洗脱

① 为洗脱mRNA,将最终的SA-PMPs重悬于0.1ml的无RNase的水中,温柔地轻弹离心管以重悬颗粒。

② 65℃水浴2分钟。

③ 用磁场捕获SA-PMPs,8000rpm离心30秒。

④ 将含有洗脱的mRNA的液相移入一无菌的、无RNase的离心管中。勿将颗粒丢弃。

⑤ 重悬SA-PMP颗粒于0.15ml的无RNase的水中,65℃水浴2分钟,用磁场捕获SA-PMPs,8000rpm离心2分钟。将洗脱液与5. ④ 步骤中洗脱的mRNA合并。

⑥ 如果这时有任何颗粒也被携带到终溶液中,可用10,000×g,4℃,5-10分钟的离心来去除。小心地将RNA转入一新鲜的无RNase的离心管中。

6.mRNA的浓缩

① 加入等体积异丙醇,混匀。通常立刻有肉眼可见之沉淀生成,立即以12000rpm离心10分钟,沉淀mRNA。或根据沉淀生成的难易,-20℃放置数小时或过夜再沉淀。

② 小心倒去异丙醇,加75%乙醇洗涤。

③ 小心倒去75%乙醇,室温干燥。

④ 将mRNA溶于20ul无RNase的水中。注意管壁上通常会粘附大量mRNA沉淀,用枪头吸取水滴在管壁上滚动数次以尽可能回收mRNA。

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