从RNA中提取mRNA的方法
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采用Promega公司的PolyATract® 26reg;mRNA Isolation System III。
使用该试剂盒,mRNA产量极低,因此下述方法是以Promega公司试剂盒操作手册为基础,并采用储昭晖硕士(作物遗传改良国家重点实验室植物分子生物学水稻分室)所建议的改进方法综合而成。
由使用者自备的材料
65℃水浴
无菌的、无RNase的1.5ml塑料离心管
无菌的、无RNase的加样枪和枪头
操作步骤
1. 探针的退火
1)在一个无菌的、无RNase的离心管中,加入未稀释的总RNA溶液,使终体积达到1.5ml.可使用更大量的总RNA,其浓度可至过饱和,即有絮状RNA沉淀析出,但当有絮状RNA沉淀存在时,后续的退火反应操作会受到一定程度影响;也可使用更少量的总RNA(50ug),但mRNA产量可能无法保证。
2)将离心管置于65℃水浴中10分钟或略长时间。
3)加入15ul 的Biotinylated-Oligo(dT)探针和39ul的20%26times;SSC到RNA中。颠倒数次以混匀,静置于室温下至充分冷却。这将需要10分钟或略少的时间。在该溶液冷却期间,制备0.5%26times 和0.1%26times SSC贮存液
2. 贮存液制备
1)通过在三个无菌的、无RNase的离心管中各自混合30ul的20%26times SSC和1.170ml的无RNase的水来制备三份1.2ml的无菌的0.5%26times SSC.
2)通过在三个无菌的、无RNase的离心管中各自混合7ul的20%26times SSC和1.393ml的无RNase的水来制备三份1.4ml的无菌的0.1%26times SSC.
3. 链霉抗生物素蛋白-磁珠(Streptavidin-Paramagnetic Particles)的漂洗
1)取三管链霉抗生物素蛋白-磁珠,轻弹离心管的底部使SA-PMPs重悬直至其充分分散,吸取悬液合并于一管。
2)使汇总的SA-PMPs重悬直至其充分分散,然后将离心管置于磁柱中直至SA-PMPs已经聚集在离心管壁上(大约30秒)。小心地移出上清。不要离心沉淀颗粒。
3)用0.5%26times SSC漂洗SA-PMPs三次(每次0.9ml),每次都使用磁柱来捕获它们,然后小心地移去上清。
4)重悬漂洗过的SA-PMPs于0.3ml的0.5%26times SSC中。
4. Oligo(dT)-mRNA退火杂合体的捕获和漂洗
1)将退火反应的全部成分加入到含有漂洗过的SA-PMPs的离心管中。
2)室温下静置10分钟。每1-2分钟轻柔地颠倒一次以混匀。
3)用磁柱捕获SA-PMPs,小心移去上清,注意不要搅动SA-PMPs颗粒。当总RNA为过饱和高浓度时溶液时,退火反应易形成黑色絮状物,磁柱吸附也难以压缩其体积,这时应小心吸取上清;保留上清直至确信mRNA的结合与洗脱已是令人满意。
4)用0.1%26times SSC(每次0.9ml)漂洗颗粒4次,其间轻弹离心管底部直至颗粒已被重悬。最后一次漂洗后,在不搅动SA-PMPs的前提下,以8000rpm离心1分钟,尽可能多地移出液相。