龙大人驾到
在 qPCR 实验中,内参基因(也称为参考基因或稳定表达基因)应该具有相对稳定的表达水平,不受实验条件或处理的影响。它们通常用作标准化因子,用于对目的基因的表达进行相对定量。一般情况下,内参基因的表达值应该与目的基因的表达值接近。
如果在 qPCR 实验中发现内参基因的值普遍比目的基因的值大,这可能是由于以下原因之一:
1. 选择不合适的内参基因:内参基因的选择是关键步骤,应该选择具有稳定表达水平的基因作为内参。如果选择的内参基因在实验条件下发生了变化,就会导致内参值与目的基因值的差异。
2. 执行问题:在实验过程中可能存在技术操作上的问题,如反转录反应不均一、PCR扩增效率差异等,这些问题可能导致内参基因的表达值异常偏高。
3. 样本差异:如果样本之间存在差异,如基因表达水平的差异或处理效应,也可能导致内参基因的表达值与目的基因的表达值不一致。
当发现内参基因的值普遍比目的基因的值大时,建议进行以下措施:
- 重新评估内参基因的选择,确保选择的基因在实验条件下表达稳定。
- 检查实验操作步骤,确保操作的一致性和准确性。
- 考虑检查样本处理过程中是否存在系统性差异,可能需要重新优化实验流程或重复实验。
如果问题仍然存在,可能需要进一步评估实验设计和数据分析方法,或者尝试使用其他标准化方法或不同的内参基因进行校正。
skyye
内参的CT值是多少呢?一般来说,内参是属于管家基因,在不同细胞中都稳定表达的,因此在不同细胞或组织中表达量都比较高。个别目的基因的CT值比内参低是可能的,但都低就不大正常了,需要回溯一下是不是加样过程中存在问题,或者内参的引物是不是过期降解了等。
土井挞克树
内参偏大说明选择的内参不合适,建议更换内参类型
静心观照
可能原因:
1,内参引物效果不佳:可能原因是引物设计存在问题,比如存在引物二聚体等;另外,也有可能是引物使用时间过久或者保存不当,出现了降解。
2,RNA质量不好,比如260/280, 260/230值偏低;
3,反转时RNA含量过低;
4,定量时cDNA以及引物含量偏低;
周末也要努力呀
一般不会,看一下目的基因引物特异性怎么样。线粒体基因可能会出现这种情况
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