qPCR的引物要怎么才能两个种属通用呢？

我在网上有查到可以选取一个基因的两个种属的CDS序列，然后取他们的相同部分，我又查到bioedit可以做序列比对，就下载了软件进行了序列比对，但后面的步骤，比如有很多相通的序列到底该选哪一段就找不到了，所以想请教一下懂的大佬帮忙解答一下，感激不尽