求多个基因变体如何设计引物

最好设计三对引物，一对为同源序列，另两对分别针对特异序列，这样分析出来的结果更丰富。

如果有一个Transcript variant不能设计特异的序列，就设计另一个Transcript variant的特异性序列和两个Transcript variant的同源序列即可。

我认为，分别测定两具Transcript variant的表达水平比较好，因为两个Transcript variant的干扰效果可能不一样。

对于有多个变体的基因，看具体哪个变体有功能就设计这个的

如果仅仅检测这个基因的表达量，可以将引物设计在这多种变体的保守区域内，就是所有变体都包含的区域。如果明确要检测哪一个变体，就设计在这个变体独有的区域内。

2引物blast后的产物有多种

应该是在NCBI上进行的primer blast。只要看到引物扩增出来的都是要的目的基因就好了。在NCBI上有很多标记，一般认为NM的是NCBI上认可的reference的序列，NX是用户上传还未认证的序列，忽略也是可以的。predicted是指用户预测的序列，建议还是用NCBI认证的序列。

你列举的引物如果对应单一基因可以得到特异性序列，所以可以分别设计引物，然后再进行序列对比

多个基因变体设计引物要分别设计，像你是共同设计就会混乱，应该分开设计

你如果仅仅检测这个基因的表达量，你可以将引物设计在这多种变体的保守区域内，就是所有变体都包含的区域。如果你明确要检测哪一个变体，就设计在这个变体独有的区域内。