嘿半糖去冰
人群几百个样作PCR 我们没分组就开始跑PCR 想着最后分组计算 对照人群分组可能会有几百个 求问到时候怎么计算ddCT感谢
bamboopiggy
这个需要每个sample计算自己的delta delta ct值,所以几百个人和一个人的算法都一样
天一湖医者
基本原理是用最小二乘法求。先将数据按大小排序,计算相邻数据之间的标准差。如果需要分组后,各组平均数,平均数之间数据方差最小(各组数据的平均值尽量相等),可以采用首尾截取分组的办法。如果需要使得每个分组中的数据,方差最小,可以设置一个初始的方差上限值,然后将相邻数据分成几组(满足方差小于这个上限),不断迭代,获得最优值。
Eason老歌迷
计算每个样本每个基因对应的Ct均值(每个组、每个样本、每个基因的复孔Ct均值)。然后把(每个组、每个样本、靶标分子的 Ct 值)减去(同一个样本内参分子的Ct值),得到每个组每个样本靶标分子的∆Ct值。单独计算(上一步)对照组所有样本中靶标分子的∆Ct算术均值。(每个组每个样本靶标分子的∆Ct值)(第二步)减去(对照组所有样本中靶标分子的∆Ct 均值)(第三步),得到每个组每个样本靶标分子的∆∆Ct值。由第4步得到的每个组每个样本靶标分子的ΔΔCt 值,经过2^-ΔΔCt计算,最终得到靶标分子在每个组每个样本对应的相对表达量。
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