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做qPCR曲线出现异常?

相关实验:实时荧光定量 PCR(realtime PCR)

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嘎萌gm

做q的时候扩增曲线 出现了类似于S 型的曲线是为什么?

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5 个回答

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whilt-shirt

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有可能是模板浓度太高了,在基线期内就起峰了,仪器会默认起峰的线条仍为基线部分,将扩增曲线往基线位置下拉,因此你的曲线就趴下来了。这种情况大家也不要慌,可以减小基线终点(例如基线期默认 3 - 15 个循环,改为 3 - 10 个循环),重新分析数据,一般都能得到一个比较好的结果。

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dxywode

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反应体系引起的扩增曲线不光滑---扩增效率偏差(过高或过低)

A. 扩增效率过高

出现非特异扩增或引物二聚体:反应体系内模板浓度太高以及模板核酸质量较差,可能导致出现抑制 PCR 反应的现象。在绝对定量时表现扩增效率大于110%。

解决方案:去除模板浓度最高的反应孔并重新分析标准曲线;对目的基因做标准曲线,一般用质粒做梯度稀释,或用 PCR 产物做梯度稀释,然后做定量扩增,通过曲线评估反应效率。绝对定量有效的扩增效率在 90%-110%;重新纯化模板,去除模板中存在的潜在抑制物。

B. 扩增效率过低

扩增效率过低主要表现在试剂浓度不适(主要是引物、镁和 Taq DNA 聚合酶,尤其是在多重实验中),引物对Tm之间的差异超过5°C以及热循环条件不适,试管中各种同源物质的竞争作用可造成反应效率低下。绝对定量表现:扩增效率<90%。

解决方案:对上述因素逐一排除后进行调整优化实验体系或选用Biog、ABI等质量比较稳定的试剂盒。

C. 个别扩增曲线异常

如个别扩增曲线突然骤降:反应管内留有气泡,由于温度升高后气泡破裂,使仪器检测到的荧光值突然降低所致。进行扩增反应之前要仔细检查反应管内是否有气泡残留。

仪器设置不当引起的曲线异常:基线设置不当,如扩增曲线断裂或下滑:基线的终点值大于 Ct 值。减小基线终点 (Ct 值- 4),重新分析数据。

Rox 添加不当:表现为扩增曲线呈锯齿状且不连续,需校正参比染料。

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汤姆卜丽波

有帮助

是指这样的曲线么这种就是模板加多了,不过也不影响你分析数据,看一下趋势,然后再做重复

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秋秋欣欣

有帮助

可能原因是模板浓度太高,基线下移。可以将基线设置在3-15个循环开始

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bamboopiggy

有帮助

可能是你的pcr那个孔有问题,或者是加热模块有问题

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