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细菌QPCR相关问题请教

相关实验:定量PCR技术

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周末也要努力呀

大家都做的细胞QP比较多,细菌不知道到哪里去找答案,谢谢大家

1.细菌引物内参一般选择哪个呢?有人说国内外不认16Srna?

2.你们的细菌提取Rna使用Trizol还是试剂盒呢?试剂盒哪家的有推荐吗?

3.我提的细菌Rna浓度2000+,但是纯度不够,上机器Qp之后CT测不出来,我的浓度已经很大了,原则上纯度也影响QP结果吗?

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3 个回答

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Topmicro

有帮助

你提取的RNA肯定是有问题的,不单纯是纯度的问题,你最好使用试剂盒来提取,简单还能保证提取质量,可以用天根的试剂盒。

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bamboopiggy

有帮助

1.没有做过细菌的,但是我觉得细菌可以当作细胞来做,你可以同时试试16s,及recA或GAPDH

2.Rna使用用Trizol和试剂盒都可以,市面上可以提细胞和组织的kit都可以。

3.纯度比浓度更重要,因为260/230不好的话,可能你测的浓度是不准的。

2022-05-06

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天一湖医者

有帮助

理想的内参基因应该满足以下条件:

1.不存在假基因(Pseudogene),以避免基因DNA的扩增;

2.高度或中度表达,排除低表达;

3.稳定表达于不同类型的细胞和组织(如正常细胞和癌细胞),而且其表达量是近似的,无显著性差别;

4.表达水平与细胞周期及是否活化无关;

5.其稳定的表达水平与目标基因相似;

6.不受任何内源性或外源性因素的影响,如不受任何实验处理措施的影响。

在进行RT-qPCR实验之前,必须正确选择内参基因。那么在选择内参基因时,可以通过geNorm、BestKeeper、NormFinder、RefGenes 等工具来评估,这是保证结果可靠准确的前提。其次可对候选的内参基因进行qPCR 实验做进一步的筛选。首选在不同样本中均稳定表达的内参基因,即比较各样品中Cq平均值以及Cq值的标准偏差,选择SD最小的基因作为实验内参。

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