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定量PCR技术

实验分类:

PCR 技术

别名:

RNAi

最新修订时间:

简介

定量PCR是指以一种标准作对照,通过对PCR终产物的分析或PCR过程的监测,对PCR起始模板量进行定量的技术。

根据原理的不同,目前主要采用的定量PCR方法包括极限稀释法、设立内参照物的定量PCR、荧光定量 PCR (fluorescence quantity PCR,FQ-PCR)等。

其中荧光定量PCR是最新发展起来的一项定量PCR技术。

原理

荧光定量PCR基本原理是在PCR反应体系中加人荧光基团,在PCR反应过程中连续不断地检测反应体系中荧光信号的变化,当信号增强到某一阈值,此时的循环次数即循环阈值Ct(cycle threshold,Ct)被记录下来。

该循环参数Ct和PCR体系中起始模板数的对数之间有严格的线性关系,利用不同梯度的阳性定量标准模板扩增的Ct值和该阳性定量标准的模板数经过对数拟和作图,制成标准曲线。

最后根据待测样品的Ct值,通过标准曲线就可以准确地确定起始模板的数量。根据所用的探针的不同,可以分为两种,一种是Taq-man荧光探针,另外一种是荧光染料。

Taqman的工作原理是在PCR的系统中加入一个荧光标记探针,该探针可与引物扩增的产物DNA模板发生特异性杂交,探针的5'端标以荧光发射基团FAM(荧光发射峰值在518 nm处),3'端标以荧光猝灭基团TAMRA(6-羧基四甲基罗丹明,荧光发射峰值在582 nm处)。

且末端碱基被磷酸化以防止探针在PCR扩增的过程被延伸,当探针保持完整时,猝灭基团抑制发射基团的荧光发射,发射基团一旦与猝灭基团发生分离,抑制作用被解除,518 nm处光密度增加被荧光系统检测到。

在PCR的复性过程中,探针与模板DNA杂交,在延伸过程中,Taq酶随引物延伸到探针与模板结合的位置时,发挥5'→3'的外切酶活性,将探针切断,FAM的荧光信号释放出来。

这样一来,模板每复制1次,就有1个探针被切断,伴随着1个荧光信号的释放。

荧光信号强度与PCR产物的数量是一对一的关系,因此该技术可以动态观察PCR的反应过程,对模板进行准确定量。

SYBR是不对称菁类荧光素,它非特异嵌合于DNA双螺旋结构中的小沟内,发出荧光信号,而不掺入链中的Sybr染料分子不会发出任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与PCR产物的增加完全同步。

此方法避免了设计、标记荧光探针和使用价格昂贵、复杂的试剂,适用于任何PCR扩增体系。

来源:丁香实验团队

操作方法

荧光定量 PCR

定量 PCR 是指以一种标准作对照,通过对 PCR 终产物的分析或 PCR 过程的监测,对 PCR 起始模板量进行定量的技术。根据原理的不同,目前主要采用的定量 PCR 方法包括极限稀释法、设立内参照物的定量 PCR、荧光定量 PCR (fluorescence quantity PCR,FQ-PCR)等。其中荧光定量 PCR 是最新发展起来的一项定量 PCR 技术。

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