多转录本如何设计引物

要看你的个人需要和方向了，根据不同的要求选择不同扩增方式，首先如果你扩增原核生物基因，那就是要的基因dna序列的orf区，从atg到taa，因为原核基因一般没有内含子，只需从基因组中扩即可；如果你要克隆表达真核基因，那么就要提取rna，逆转录成cdna之后设计引物扩增全cds区，当然如果你要研究整个基因的mrna的话，也可以用3‘或5’ -race kit 拉全长，这个难度稍高一点，如果只是要比较该基因的相对表达量，用定量pcr的话，只需针对该mrna序列合适位置设计100-250bp长度的引物即可，一般位于cds区，引物尽量在相邻exon接缝处。

UniProt一般第一个展示的isoform就是该蛋白的经典转录本

你先设计引物，然后去跟这些转录本比，最好所有转录本都可以有这段引物，就可以了。