全基因组测序

这个可以在基因组测序网站分析，还可以去类似ncbi分析

全基因组测序的数据分析是一项复杂的任务，需要进行多个步骤的数据处理和分析。以下是一个简单的数据分析流程，供参考：

质量控制和去除低质量数据：使用工具如FastQC和Trimmomatic等对测序数据进行质量控制和去除低质量数据。

序列比对：使用工具如Bowtie2和BWA等将样本的测序数据比对到基因组参考序列上。

变异检测：使用工具如GATK和VarScan等检测样本中的变异，如SNP、InDel等。

注释和功能分析：使用工具如ANNOVAR和SnpEff等对检测到的变异进行注释和功能分析。

变异差异分析：将实验组和对照组的变异进行比较，可以使用工具如DESeq2和edgeR等进行差异分析。

根据您的需求，您可以关注上述步骤中的第5步，使用相应的差异分析工具比较实验组和对照组的基因变异情况。在进行差异分析时，需要注意选择合适的差异分析模型，控制假阳性和假阴性的比例，进行多重检验校正等问题。

一般的在线分析网站可以做一些简单的分析，复杂的分析就要用到R了