差异分析是关注上调蛋白还是下调蛋白

两个方向都要关注，但是一般造成差异的是某个通路的上调，所以优先关注上调的，如果分析不出来，再看下调的也可以

上调蛋白决定差异的方向，下调蛋白只是辅助

差异分析通常关注的是上调蛋白，即在某一特定组（例如疾病组）相比于另一组（例如对照组）表达水平显著增加的蛋白。下调蛋白，即表达水平显著降低的蛋白，也是有关注的对象。