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怎么构建一种能在细胞中产生环状RNA的质粒?有什么参考资料?

相关实验:质粒构建技术

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dxy_j7jezao0

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3 个回答

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汤姆卜丽波

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参考一下这个文章https://wap.cnki.net/touch/web/Conference/Article/ZGXJ201711001258.html

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bamboopiggy

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环状RNA(circular RNA,circRNA)是一类特殊的非编码RNA分子,与传统的线性RNA(linear RNA)不同,它是通过反向剪接形成的闭合RNA分子。circRNA不具有5'末端帽子和3'末端poly(A)尾巴,通过外显子环化或内含子环化,将3'和5'末端连接起来形成完整的环形结构,避免被核酸外切酶降解,因而比线性RNA更稳定,更具有保守性。

现在对于circle RNA有各种各样的包装载体,腺病毒、慢病毒和AAV全套circRNA过表达和干扰载体的系统

你可以参考:http://www.wzbio.com.cn/special.php?cid=89

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未来9

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circrna表达载体是研究circrna功能机制必不可少的工具。

现有技术方案一的内容:以基因组dna为模板,以环状rna编码序列为中心,扩增其上下游很长(1000bp左右)的一段序列,然后插入到普通的表达载体上,从而实现过表达该环状rna的目的;现有技术方案一的缺点是:1)环状rna形成率无法保证,环状rna的形成率往往不到该序列线性rna的10%,对后继研究造成影响,2)pcr扩增片段长,难度大,周期长。

现有技术方案二的内容:目前大部分商业化的环状rna过表达载体,通过将某个环状rna上下游成环序列框架连接到一般的商业过表达载体上,中间添加一些克隆位点,达到方便快速表达不同环状rna的目的;现有技术方案二的缺点是环状rna基因片段两端必须加入酶切位点,才能保证环状rna基因能够连接到载体上,所加入的酶切位点序列会自动环化进环状rna中,所表达出来的环状rna会多出酶切位点的序列,可能会改变原环状rna的功能。因此这种方法不能准确地表达环状rna。

现有技术方案三的内容:根据环状rna的剪接原则,在某个环状rna上下游成环序列之间添加econⅰ(酶切产物的粘性末端只有一个碱基)和pmlⅰ(酶切产物是平末端)的识别序列,用econⅰ和pmlⅰ双酶切环状rna表达载体,线型环状rna表达载体的两端正好是剪接位点,利用重组的方式将目标环状rna的编码序列连接到环状rna表达载体中,实现环状rna的无缝环化;现有技术方案三的缺点econⅰ和pmlⅰ不是常用的限制性内切酶,活性较低,价格较高。

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