yuanxia84 :)各位前辈好,本人是分子生物学的初学者,刚接触DNA突变方面的实验,想请教各位前辈,如何有效地发现DNA新的突变位点,恳请各位前辈不吝赐教。非常感谢!!zjubell 要发现新的,测序是唯一的方法。yuanxia84 请问有哪些测序方法,哪些方法即简单又高效,还成本较低,谢谢zjubell yuanxia84 wrote:请问有哪些测序方法,哪些方法即简单又高效,还成本较低,谢谢如果你知道大概位置,就直接提DNA, ...
yuanxinke 请问MicroRNA前体和mimic试剂盒有什么区别吗,现在国际上主流是使用哪种?谢谢!zhujoker 效果都是一样的,都是瞬转后能够表达成熟的miRNA。至于哪个是主流,这个就要看你的实验具体而言了,有的miRNA的mimic工作效果不好,所以有瞬转的前体了。仅供参考!路得自己走 跟着版主,再回一条!我们实验室做过mimics和基于质粒过表达miRNA前体序列,个人比较喜欢后者(还不知道是否可以转染 ...
fanxiaochou 请教:CONSTANS(CO)是什么?谢谢slytjiaofei CONSTANS是一个基因的名字,CO是它的缩写,建议自己先在baidu上搜搜,以下链接可参考以下!!!http://d.wanfangdata.com.cn/Periodical_fdxb200605021.aspxfanxiaochou CONSTANS是长日照途径上控制开花的基因,这个基因的具体信息查不到,想多了解一点。qzhaojing ...
biophysics hsa-miR-3155 is not in our miRNA database.targetscan 5.1新收录的在哪个库可以预测靶基因?freecell 网上预测工具很多,你只有逐个去验证了。http://www.exiqon.com/microrna-target-predictionhttp://www.ncrna.org/KnowledgeBase/link-database/mirna_target_databasebi ...
zqooo 试验中涉及检测某microRNA在组织和细胞中的表达,参照文献第一步须将microRNA逆转录为cDNA,常用microRNA特异的stem-loop引物,如果参考文献由公司合成microRNA特异引物(线性),这种引物是在逆转录试验中自动形成stem-loop,再和microRNA结合,还是在逆转录实验前需要将特异引物转为stem-loop,请战友指教,谢谢。zhujoker 请参阅下帖:http://www ...
tyoutei 我做wb,ECL发光的时候,在发光液里能看到清楚的条带,但每次拿出条带准备压片的时候,条带就消失了,怎么都压不出来,请问是什么问题呢?bianbenjamin 二抗浓度过大,迅速淬灭了tyoutei bianbenjamin wrote:二抗浓度过大,迅速淬灭了谢谢!问题已经解决了,不过是提高了抗原浓度,呵呵!本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙伴师 ...
free123 请问各位高人,如果ip证实A蛋白与B蛋白有相互作用,如何研判两者的作用是受体配体的作用还是一般的蛋白相互作用?谢谢!gingivalis 我倾向于不要把 蛋白质之间属于受体配体结合还是其他相互作用区分得如此严密。受体配体原指胞外信号分子(主要是化学小分子)与膜受体之间的相互作用。其特点是特异性,高亲和力,饱和性,可逆性,引发生理反应,比如G蛋白。(胞内受体配体也是同样的,比如核受体)从这几点出发,要区分两(多)个 ...
gaoyongxin 如何给提取的RNA加A尾(poly A)zjubell 先问一下,你有何目的?如果是真核的,提的RNA,一般都带polyA,如果是原核的,那你要加A做什么?gaoyongxin 我提的是血清的RNA 但是后期要做microRNA的qRT-PCRzhujoker 请参考下面这篇文献:PNAS published ahead of print July 30, 2008,doi:10.1073/pnas.0804549105Circulating m ...
husttjmu 各位战友由于条件限制和一点别的原因,组织样本取出来以后不得已在常温下放置了大概30分钟。不知道这样以后,样本是否依然可以用来做免疫组化和免疫荧光呢?对做western blot和RNA提取有多大的影响呢?感谢各位战友的帮助和支持!zjubell 常温下放半小时,对蛋白和RNA基本上无任何影响(当然得看你的需求了),一般情况下的实验都没问题,包括基因芯片和测序。如附图。我对此专门做过测试,RT下放1小时,基 ...
honestrety 各位大大,本人想做DSPP基因在细胞分化前后的DNA甲基化状态的比较,有些困惑还望指教:1.是否应该要做全基因(包括编码区和非编码区)的DNA,还是只做cDNA就可以2.用哪种方法检测为好,个人考虑用重亚硫酸盐处理后行直接测序的方法,不知是否可行?3.引物设计上有什么需要特别注意的?小弟是新人,先在此谢谢各位大大不吝赐教了slytjiaofei 1.DNA甲基化研究的是转录水平对表达的影响,当然要用 ...
pozeta 我做的是梗阻性黄疸的大鼠模型,想要测定模型的肝细胞内钙离子浓度,有什么具体方法呢?希望园子里的前辈指教!!ylhuang0502 这方面的文献,非常多,自己先看看文献,这方面的文献绝对成千上万。常用的Ca2+ indicator如fura-2, fura-4,你如果要测绝对浓度,则需要钙离子标准液,要麻烦一些。pozeta ylhuang0502 wrote:这方面的文献,非常多,自己先看看文献,这方面的文献绝对成千上万。常用的 ...
sakura042 本新手欲研究nfkb引起内皮细胞凋亡的机制:是否通过jnk通路。这是否是一个信号通路串话的问题?我们用特异性抑制剂阻断nfkb后发现jnk活性下降,是否就能说明nfkb促进内皮细胞凋亡是通过jnk通路呢?还需要再阻断或者过表达jnk通路来反证吗?这个问题困扰了我好久,请教各位高手。sakura042 自己顶一下三叶虫 请问一下你是通过什么方法检测NF-kB的活性的?sakura042 我就做western ...
edwardellen 求助!!!本人菜鸟,最近开始接触凋亡相关信号,在HepG-2中做实验,有一点很困惑,HepG-2中的p53是野生型的还是突变型的?还是两者都存在?查了一些资料,有些文章之间表达的意思模凌两可。困惑啊!哪位好心的达人能给我一个确定的答案呢?另外,是否有做p53相关的牛人能告诉我P53在哪些实验用肿瘤细胞系中是野生型的,在哪些是突变型的?谢谢!谢谢!谢谢!doctormy HepG2是p53野生型的。如果你 ...
wxhong 大家好,最近加入了一个课题,由于本人经验很浅,于是上 来向大家讨教经验。我把我们的实验流程写下了,大家帮忙看看,给写建议,谢谢大家对细胞染毒----CCK-8法测IC50-----以 IC50为最高浓度递减对细胞染毒----通过Western blot做目标蛋白的表达量变化----使用重叠PCR法将TAP基因立连上目标基因----构建pcDNA3.1/重组载体----荧光定量PCR和 Western Blot检测组合蛋白的表达-----用TAP法 ...
lyc_urology 本人研一,需要做下调肿瘤细胞系中某一miRNA,并检测下游蛋白变化。但是用什么方法能特异有效地降低某一miRNA呢?Antagomir能用于细胞系研究吗?它与inhibitor比较哪个效果较好啊?除此之外还有什么其他方法吗?下调成功后,还想做MTT,流式细胞仪检测细胞周期,细胞克隆实验等,我应该选什么方法下调目标miRNA呢?恳请前辈赐教啊!Victor001 Ambion antisense inhi ...
yehuanlr 本人是新手,所以说得不专业的地方,敬请谅解!别人建立了cDNA文库,通过对文库的分析,分析了一些新的基因,在数据库中没有发现其同源序列,他只通过RT-PCR确定了这几个新基因在某些组织中转录,就此推断了该基因具有的可能功能。这些功能正好是我所想研究的,所以想研究这些基因。但是我所研究的鱼繁殖周期很长,全人工繁殖几乎还没有实现,而且没有卵子或精子给我做。请问各位前辈,具体我该怎么研究啊!!!敬请指导,十分 ...
dldenglin 求细胞核蛋白提取的试剂配方,及步骤,最好是亲自做过的方法,万分感谢dldenglin 咋没有人理我呢johndxy117 来源不明,貌似是某文献作者传授给师兄的,自己试过几次,纯度很高,在此表示感谢~密度梯度离心法提核蛋白试剂Buffer A: 1.0mM MgCl225mM KCl10mM HEPES(pH 7.5)protease inhibitors 1:200Buffer B: 0.25mM sucrose in Buffer ABuffer N: 1.1mM su ...
手指爱上烟 在下新手,可能这个问题比较幼稚,请路过高手帮忙!中间的序列代表什么?空白和加号有何区别?多谢!!吴佰霖 空白 很明显是两个位置的氨基酸不一致星号 氨基酸不一样,但是化学性质相近手指爱上烟 谢谢楼上的解答,在别处也得到战友的相似解答——两个残基容易相互突变,因此在比对的时候认为它们相似。序列比对是需要打分矩阵的,蛋白质比对请查询常用打分矩阵如BLOSUM62等等你就明白了http://www.uky.edu/Classes/B ...
bailamo27 这个问题可能是因为我基础不好吧,所以一直没弄懂,在研究中DNA/mRNA/蛋白水平的研究有何不同?为什么有些时候用PCR,有时候用RT-PCR,有时候用Western blot?例如,对于某个信号蛋白,文献报道有突变体,即在其某个外显子上有几个氨基酸的缺失,那么要研究这个突变的蛋白的功能应该在哪个层面呢?应该用WB吧,看其下游信号通路蛋白的表达变化?那有的文献又报道下游通路的关键蛋白的mRNA的变化, ...
antonio2001 调节细胞增殖 的信号通路有哪些? 那个最重要!!sakura042 Akt通路?ylhuang0502 PI-3K/AKT肯定可以,但问题是,谁最重要?还真是一个好问题?!期待高手回答。chuckdouble antonio2001 wrote:调节细胞增殖 的信号通路有哪些? 那个最重要!!这个问题好比,一个光棍在找对象时问别人"好女人都有哪些,哪个最好?":D:Dylhuang0502 chuckdouble wrote:这个问题好比, ...