【求助】blastp 比对结果中间一行空白和加号各代表什么意义？
丁香园论坛
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在下新手，可能这个问题比较幼稚，请路过高手帮忙！
中间的序列代表什么？空白和加号有何区别？多谢！！
中间的序列代表什么？空白和加号有何区别？多谢！！
空白 很明显是两个位置的氨基酸不一致
星号 氨基酸不一样，但是化学性质相近
星号 氨基酸不一样，但是化学性质相近
谢谢楼上的解答，在别处也得到战友的相似解答——
两个残基容易相互突变，因此在比对的时候认为它们相似。
序列比对是需要打分矩阵的，蛋白质比对请查询常用打分矩阵如BLOSUM62等等你就明白了
http://www.uky.edu/Classes/BIO/520/BIO520WWW/blosum62.htm
bits score是被E value 修正过的。括号里面的是按分数矩阵与gap情况直接加出的分。
看来这个东西还挺复杂的，因为刚刚接触blast，所以还要仔细学习
两个残基容易相互突变，因此在比对的时候认为它们相似。
序列比对是需要打分矩阵的，蛋白质比对请查询常用打分矩阵如BLOSUM62等等你就明白了
http://www.uky.edu/Classes/BIO/520/BIO520WWW/blosum62.htm
bits score是被E value 修正过的。括号里面的是按分数矩阵与gap情况直接加出的分。
看来这个东西还挺复杂的，因为刚刚接触blast，所以还要仔细学习
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