引物设计操作流程

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引物设计 操作流程：序列下载——同源性比较——引物设计 筛选

1.序列查找

根据所需检测的病原体或者待检特定基因，在http://www.ncbi.nlm.nih.gov/网址查询有关序列。

2、同源性比较 主要有两种方法

A、在www.NCBI .nlm.nih.gov/Blast/blast.cgi 网址进行在线的两两比较。

B、采用OMIGA, PCGENE等软件 进行两两或多序列比较。

1)打开OMIGA软件，导入(import)下载存盘的纯文本序列文件：

2)选择待比较的多条序列，右键点击“align sequences”命令;

3)等待计算机处理，直至状态显示排列结束，点击“alignment”显示结果;

4)“alignment”结果，相同碱基以同色标记