RNA变性电泳法检测RNA质量
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采用RNA变性电泳法检测RNA质量,方法如下:
⑴ 凝胶制备:
制备1.2%琼脂糖凝胶(电泳槽体积为50ml)
① 称取0.6g琼脂糖,加入43.5ml水,加热溶解并降温到60℃。
② 加入5ml 10×甲醛变性电泳缓冲液,并加入1.5ml 37%的甲醛,混合均匀。
③ 倒入电泳槽中制胶(甲醛有毒,制胶应在通风橱中进行)。
⑵ RNA模板准备(5~7.5μg total RNA)
① 制备如下混合液 (9.7μl)
10×甲醛变性电泳缓冲液: 1.25μl
37%的甲醛: 2.2μl
甲酰胺: 6.25μl
② 加入2.8μl RNA,使总体积达到12.5μl
③ 混合后离心5~10 sec(1 000~2 000 r/min)
④ 55℃加热15 min
⑤ 加入2.5μl甲醛凝胶加样缓冲液,再加点EB(约0.2~0.5μl),混合后离心5 sec
⑥ 将样品加入点样孔
⑦ 在5v/cm的电压下电泳至溴酚蓝带跑到电泳槽中央(20cm长电泳槽,用95v电压,1小时左右)